Engelsmännen (från 1707Storbritannien) gjorde anspråk på öarna efter en expedition på 1570-talet av Martin Frobisher. Kanadas överhöghet över öarna erkändes av Storbritannien först 1880[1] och 1895 upprättades Franklindistriktet. Kanada gör dessutom anspråk på överhöghet över en sektor som sträcker ända till nordpolen, anspråk som inte har erkänts internationellt. Kanada betraktar också vattnen mellan öarna som sitt innanhav, något som inte erkänns av USA. Detta har skapat konflikter då man försökt upprätthålla miljöbestämmeler. Mellan Kanada och Danmark rådde oenighet kring den obebodda Hans ö utanför Ellesmereöns östkust, tills i juni 2022.