Harku kommun (estniska: Harku vald) är en kommun i landskapet Harjumaa i nordvästra Estland. Den ligger utmed Finska viken, direkt väster om huvudstaden Tallinn. Centralort är småköpingen Tabasalu.
Kommunens yta utgörs av två från varandra geografiskt åtskilda delar där småköpingen Harku utgör en exklav, belägen cirka 50 meter ifrån den övriga kommunen.
I Harku kommun finns två småköpingar och 20 byar.