Carl Johan Bonnesen, född 26 maj 1868 i Aalborg, död 13 december 1933 Köpenhamn, var en dansk skulptör.
Carl Bonnesen utbildade sig på Det Kongelige Danske Kunstakademi i Köpenhamn 1887-89 för Theobald Stein och Christian Carl Peters. Han hade kontakt med Stephan Sinding i Paris 1894-95. Han arbetade från sin debut 1889 främst med barbartyper, som Från hunnernas tid (brons, 1893) i Kunstmuseet, Köpenhamn. Andra exempel på hans verk är fontängruppen Tors strid med jättarna utanför Ny Carlsbergs bryggeri och Diana på jakt vid Trondhjems plads i Köpenhamn.
En stor del av Carl Bonnesens gipsmodeller finns idag i de nedlagda kalkgruvorna i Tingbæk på norra Jylland tillsammans med gipsmodeller av Anders Bundgaard.
^Andreas Beyer & Bénédicte Savoy (red.), Artists of the World Online, K.G. Saur Verlag och Walter de Gruyter, 2009, 10.1515/AKL, Artists of the World konstnärs-ID: 10134458.[källa från Wikidata]
^ [abc] läs online, www.kulturarv.dk .[källa från Wikidata]