Under Laws tid som ärkebiskop i Boston förekom det anklagelser mot präster om sexuellt utnyttjande av barn. Det framkom att Law hade flyttat prästerna till nya församlingar där övergreppen fortsatte, trots att han kände till anklagelserna mot dem. Efter att Laws roll blivit känd krävde aktivistgrupper som Voice of the Faithful såväl som ett stort antal präster Laws avgång. Law avsade sig ärkebiskopsstolen i Boston den 13 december 2002, och kort därefter fick han flera betydelsefulla kyrkliga uppdrag i Rom och Vatikanen. 2004 utsågs han till ärkepräst av patriarkalbasilikanSanta Maria Maggiore.