Подморница У-35, напуста 27. августа1939. године, базу Мемел, и одлази ка бази Кил, где стиже 1. септембра, а одатле полази 9. септембра на ново патролирање. Тог дана, британска подморница Урсула, испаљује прва британска подморничка торпеда у Другом светском рату, када је напала немачку подморницу У-35, на око 23 наутичке миље, северно од острва Ширмониког, Холандија, али је промашила циљ.
У 13:19 сати, 18. септембра, подморница У-35 прилази уз британски рибарски брод St. Alvis, западно од Хебрида. Немачки командант, Вернер Лот, је забележио, да 13 чланова посаде британског брода нису могла да стугну до најближег копна у претовареном чамцу за спасавање, те стога, он допушта посади да се врати на брод, али је пре тога бачен у море њихов радио уређај. По повратку на брод, посада обавештава немце о присуству носача авиона Арк Ројал, у тој области, а Лот је био упитан од заповедника рибарског брода, да му каже своје име, како би унео у свој извештај његово џентлменско понашање, међутим он то одбија да каже.
Касније тог дана, подморница У-35 зауставља једну групу од три рибарска брода, западно-севетозападно од Сент Килда. Први брод, Arlita, био је потопљен топовском ватром у 18;48 сати, а други, Lord Minto, у 19:00 сати. Трећи рибарски брод, Nancy Hague, био је остављен да покупи чланове посаде потопљених бродова.
Три дана касније, 21. септембра у 14:10 сати, У-35 испаљује три торпеда ка конвоју OA-7, југозападно од острва Сила, која промашују један разарач и један танкер, а оштећују британски танкер брод Teakwood. Оштећени брод је одвучен у Фалмут, ескортован од разарача HMS Ardent (H 41), на чијој палуби су се такође налазили рањени морнари, али је убрзо замењен од разарача HMS Vesper (D 55), и враћа се ка конвоју.
У 18:45 сати, 1. октобра 1939. године, У-35 је покушала да заустави неутрални и ненаоружани белгијски трговачки брод Suzon (заповедник Р. Лежен), који се у почетку трудио да побегне, али се зауставио након једног испаљеног пројектила из топа подморнице, и 20 његових чланова посаде почиње да напуста брод у чамцима за спасавање. Брод се прелама на два дела и тоне, након што је погођен једним торпедом.
Два дана касније, 3. октобра у 15:40 сати, грчки трговачки брод Diamantis (заповедник Панагос Патерас), који је превозио 7.700 тона руде мангана, био је погођен једним торпедом од У-35, и тоне на 40 наутичких миља западно од острва Сила. Он је био заустављен по лошем времену од У-35, у 13:15 сати, и посади је наређено да напусти брод. Прва два испаљена торпеда, експлодирају прерано, али треће погаћа и потапа брод. Како чамцима за спасавање није могло да се управља због лошег времена, немачки командант Лот одлучује да узме на палубу све чланове посаде грчког брода, и искрцава их следећег дана у залив Дингл, Ирска.
Подморница У-35 упловљава 12. октобра у базу Вилхелмсхафен, чиме завршава своје патролирање. На ново патролирање, У-35 полази из Вилхелмсхафена 18. новембра 1939. године. Дана, 29. новембра, У 35 је потопљена у Северном мору, дубинским бомбама од британских разарача HMS Kingston, HMS Icarus и HMS Kashmir. Сви чланови посаде немачке подморнице, њих 44, преживели су њено потапање, и постају ратни заробљеници.
