Ганцавички рејон обухвата територију површине 1.709,58 km² и на 9. је месту по површини међу рејонима Брестске области.[1] Граничи се са Лунинечким, Пинским, Ивацевичким и Љахавичким рејонима Брестске области на западу и југу, те са Клецким и Салигорским рејонима Минске области на северу и североистоку.
Протеже се од севера ка југу дужином од 48 km, односно 70 km од запада ка истоку. Рејоном доминирају реке Бобрик, Цна и Лањ. У североисточном делу рејона на реци Лањ саграђено је вештачко Лактишко језеро.
У северозападном делу рејона између река Бобрик и Цна (према Љахавичком рејону) налази се Гаљска мочвара површине око 6.000 ha. Мочвара је позната по доста моћним наслагама тресета просечне дебљине слојева око 1,5 метара.