RAR-srodni orfan receptor
RAR -srodni orfan receptori' (ROR) su članovi familije nuklearnih receptora intracelularnih transkripcionih faktora .[ 1] [ 2] Postoje tre forme ROR, ROR-α , -β , i -γ i svaki je kodiran posebnim genom (RORA , RORB , i RORC respektivno). ROR proteini us donekle neuobičajeni u tome da se oni izgleda da se vezuju kao monomeri za elemente hormonskog odgovora što je u kontrastu sa većinom drugih nuklearnih receptora koji se vezuju kao dimeri.[ 3]
Ligandi
Melatonin se smatra endogenim ligandom receptora ROR-α , dok je CGP 52608 identifikovan kao ROR-α selektivni sintetički ligand.[ 4] Međutim kristalografski (PDB : 1n83 i 1s0x ) i funkcionalni podaci sugerišu da je holesterol ili jedan of derivata holesterola mogući endogeni ligand.[ 5]
U kontrastu s tim, sva-trans retinoinska kiselina [ 6] se vezuje sa visokim afinitetom za ROR-β i -γ ali ne za ROR-α .[ 7]
Funkcija
Tri forme ROR receptora ispunjavaju brojne kritične uloge[ 8] uključujući:
Reference
^ Giguère V, Tini M, Flock G, Ong E, Evans RM, Otulakowski G (1994). „Isoform-specific amino-terminal domains dictate DNA-binding properties of ROR alpha, a novel family of orphan hormone nuclear receptors”. Genes Dev . 8 (5): 538—53. PMID 7926749 . doi :10.1101/gad.8.5.538 .
^ Hirose T, Smith RJ, Jetten AM (1994). „ROR gamma: the third member of ROR/RZR orphan receptor subfamily that is highly expressed in skeletal muscle”. Biochem. Biophys. Res. Commun . 205 (3): 1976—83. PMID 7811290 . doi :10.1006/bbrc.1994.2902 .
^ Jetten AM, Kurebayashi S, Ueda E (2001). „The ROR nuclear orphan receptor subfamily: critical regulators of multiple biological processes”. Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol . 69 : 205—47. PMID 11550795 . doi :10.1016/S0079-6603(01)69048-2 .
^ Wiesenberg I, Missbach M, Kahlen JP, Schräder M, Carlberg C (1995). „Transcriptional activation of the nuclear receptor RZR alpha by the pineal gland hormone melatonin and identification of CGP 52608 as a synthetic ligand”. Nucleic Acids Res . 23 (3): 327—33. PMID 7885826 . doi :10.1093/nar/23.3.327 .
^ Kallen JA, Schlaeppi JM, Bitsch F, Geisse S, Geiser M, Delhon I, Fournier B (2002). „X-ray structure of the hRORalpha LBD at 1.63 A: structural and functional data that cholesterol or a cholesterol derivative is the natural ligand of RORalpha” . Structure . 10 (12): 1697—707. PMID 12467577 . doi :10.1016/S0969-2126(02)00912-7 .
^ Donald Voet; Judith G. Voet (2005). Biochemistry (3 изд.). Wiley. стр. 1494. ISBN 9780471193500 .
^ Stehlin-Gaon C, Willmann D, Zeyer D, Sanglier S, Van Dorsselaer A, Renaud JP, Moras D, Schüle R (2003). „All-trans retinoic acid is a ligand for the orphan nuclear receptor ROR beta”. Nat. Struct. Biol . 10 (10): 820—5. PMID 12958591 . doi :10.1038/nsb979 .
^ Jetten AM (2004). „Recent advances in the mechanisms of action and physiological functions of the retinoid-related orphan receptors (RORs)” . Current drug targets. Inflammation and allergy . 3 (4): 395—412. PMID 15584888 . doi :10.2174/1568010042634497 .
Literatura
Spoljašnje veze
(1) Osnovni domeni
(1.1) Osnovni leucinski zatvarač (bZIP )Aktivirajući transkripcioni faktor (
AATF ,
1 ,
2 ,
3 ,
4 ,
5 ,
6 ,
7 ) •
AP-1 (
c-Fos ,
FOSB ,
FOSL1 ,
FOSL2 ,
c-Jun ,
JUNB ,
JUND ) •
BACH (
1 ,
2 ) •
BATF •
BLZF1 •
C/EBP (
α ,
β ,
γ ,
δ ,
ε ,
ζ ) •
CREB (
1 ,
3 ,
L1 ) •
CREM •
DBP •
DDIT3 •
GABPA •
HLF •
MAF (
B ,
F ,
G ,
K ) •
NFE (
2 ,
L1 ,
L2 ) •
NFIL3 •
NRL •
NRF1 •
XBP1 (1.2) Osnovni heliks-petlja-heliks (bHLH )ATOH1 •
AhR •
AHRR •
ARNT •
ASCL1 •
BHLHB2 •
BMAL (
ARNTL ,
ARNTL2 ) •
CLOCK •
EPAS1 •
HAND (
1 ,
2 ) •
HES (
5 ,
6 ) •
HEY (
1 ,
2 ,
L ) •
HES1 •
HIF (
1A ,
3A ) •
ID (
1 ,
2 ,
3 ,
4 ) •
LYL1 •
MXD4 •
MYCL1 •
MYCN •
Myogenic regulatorni faktori (
MyoD ,
Myogenin ,
MYF5 ,
MYF6 ) •
Neurogenini (
1 ,
2 ,
3 ) •
NeuroD (
1 ,
2 ) • NPAS (
1 ,
2 ,
3 ) •
OLIG (
1 ,
2 ) •
Pho4 •
Scleraxis •
TAL (
1 ,
2 ) •
Twist •
USF1 (1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Osnovni heliks-razmak-heliks (bHSH)
(2.1) Nuklearni receptor (Cys4 ) potfamilija 1 (
Tiroidni hormon (
α ,
β ),
CAR ,
FXR ,
LXR (
α ,
β ),
PPAR (
α ,
β/δ ,
γ ),
PXR ,
RAR (
α ,
β ,
γ ),
ROR (
α ,
β ,
γ ),
Rev-ErbA (
α ,
β ),
VDR )
potfamilija 2 (
COUP-TF (
I ,
II ),
Ear-2 ,
HNF4 (
α ,
γ ),
PNR ,
RXR (
α ,
β ,
γ ),
Testikularni receptor (
2 ,
4 ),
TLX )
potfamilija 3 (
Steroidni hormon (
Androgen ,
Estrogen (
α ,
β ),
Glukokortikoid ,
Mineralokortikoid ,
Progesteron ),
Estrogen-vezani (
α ,
β ,
γ ))
potfamilija 4 NUR (
NGFIB ,
NOR1 ,
NURR1 ) •
potfamilija 5 (
LRH-1 ,
SF1 ) •
potfamilija 6 (
GCNF ) •
potfamilija 0 (
DAX1 ,
SHP )
(2.2) Drugi Cys4 (2.3) Cys2 His2 Generalni transkripcioni faktori (
TFIIA ,
TFIIB ,
TFIID ,
TFIIE ,
TFIIF (
1 ,
2 ),
TFIIH (
1 ,
2 ,
4 ,
2I ,
3A ,
3C1 ,
3C2 ))
ATBF1 •
BCL (
6 ,
11A ,
11B ) •
CTCF •
E4F1 •
EGR (
2 ,
3 ) •
ERV3 •
GFI1 •
GLI-Kruppel familija (
1 ,
2 ,
3 ,
REST ,
S2 ,
YY1 ) •
HIC (
1 ,
2 ) •
HIVEP (
1 ,
2 ,
3 ) •
IKZF (
1 ,
2 ,
3 ) •
ILF (
2 ,
3 ) •
KLF (
2 ,
3 ,
4 ,
5 ,
6 ,
7 ,
8 ,
9 ,
10 ,
11 ,
12 ,
13 ,
17 ) •
MTF1 •
MYT1 •
OSR1 •
SP (
1 ,
2 ,
4 ,
7 ) •
WT1 •
Zbtb7 (
7A ,
7B ) •
ZBTB (
16 ,
17 ,
20 ,
32 ,
33 ,
40 ) •
cink prst (
3 ,
7 ,
9 ,
10 ,
19 ,
22 ,
24 ,
33B ,
34 ,
35 ,
41 ,
43 ,
44 ,
51 ,
74 ,
143 ,
146 ,
148 ,
165 ,
202 ,
217 ,
219 ,
238 ,
239 ,
259 ,
267 ,
268 ,
281 ,
295 ,
318 ,
330 ,
346 ,
350 ,
365 ,
366 ,
384 ,
423 ,
451 ,
452 ,
471 ,
593 ,
638 ,
649 ,
655 )
(2.4) Cys6 (2.5) Naizmenična kompozicija
(3.1) Homeodomen ARX •
CDX (
1 ,
2 ) •
CRX •
CUTL1 •
DBX (
1 ,
2 ) •
DLX (
3 ,
4 ,
5 ) •
EMX2 •
EN (
1 ,
2 ) •
FHL (
1 ,
2 ,
3 ) •
HESX1 •
HHEX •
HLX •
Homeobox (
A1 ,
A2 ,
A3 ,
A4 ,
A5 ,
A7 ,
A9 ,
A10 ,
A11 ,
A13 ,
B1 ,
B2 ,
B3 ,
B4 ,
B5 ,
B6 ,
B7 ,
B8 ,
B9 ,
B13 ,
C4 ,
C5 ,
C6 ,
C8 ,
C9 ,
C10 ,
C11 ,
C13 ,
D1 ,
D3 ,
D4 ,
D8 ,
D9 ,
D10 ,
D11 ,
D12 ,
D13 ) •
HOPX •
IRX (
1 ,
2 ,
3 ,
4 ,
5 ,
6 ,
MKX ) •
LMX (
1A ,
1B ) •
MEIS (
1 ,
2 ) •
MEOX2 •
MNX1 •
MSX (
1 ,
2 ) •
NANOG •
NKX (
2-1 ,
2-2 ,
2-3 ,
2-5 ,
3-1 ,
3-2 ,
6-1 ,
6-2 ) •
PBX (
1 ,
2 ,
3 ) •
PHF (
1 ,
3 ,
6 ,
8 ,
10 ,
16 ,
17 ,
20 ,
21A ) •
PITX (
1 ,
2 ,
3 ) •
POU domen (
PIT-1 ,
BRN-3 :
A ,
B ,
C ,
Oktamer transkripcioni faktor :
1 ,
2 ,
3/4 ,
6 ,
7 ,
11 ) •
OTX (
1 ,
2 ) •
PDX1 •
ZEB (
1 ,
2 )
(3.2) Paired box (3.3) Fork glava / winged heliks E2F (
1 ,
2 ,
3 ,
4 ,
5 ) •
FOX proteini (
C1 ,
C2 ,
D3 ,
E1 ,
G1 ,
H1 ,
K2 ,
L2 ,
M1 ,
N3 ,
O1 ,
O3 ,
O4 ,
P1 ,
P2 ,
P3 )
(3.4) Faktori toplotnog šoka (3.5) Triptofan klasteri ELF (
2 ,
4 ,
5 ) •
EGF •
ELK (
1 ,
3 ,
4 ) •
ERF •
ERG •
ETS (
1 ,
2 ,
SPIB ) •
ETV (
1 ,
4 ,
5 ,
6 ) •
FLI1 •
Interferon regulatorni faktori (
1 ,
2 ,
3 ,
4 ,
5 ,
6 ,
7 ,
8 ) •
MYB •
MYBL2 (3.6) TEA domen transkripcioni pojačivač faktor (
1 ,
2 ,
3 ,
4 )
(4) β-Scaffold faktori sa manjim žljebnim kontaktima
(4.1) Rel homologni region (4.2) STAT (4.3) p53 (4.4) MADS kutija (4.6) TATA vezujući proteini (4.7) Grupa visoke pokretljivosti HMGB (
1 ,
2 ,
3 ) •
HNF (
1A ,
1B ) •
LEF1 •
SOX (
1 ,
2 ,
3 ,
4 ,
5 ,
6 ,
8 ,
9 ,
10 ,
11 ,
12 ,
13 ,
14 ,
15 ,
18 ,
21 ) •
SRY •
SSRP1 •
TCF (
3 ,
4 ) •
TOX (
1 ,
2 ,
3 ,
4 )
(4.10) Domen hladnog šoka (4.11) Runt
(0) Drugi transkripcioni faktori
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Džep domen (0.5) AP-2 / EREBP -vezani faktori (0.6) Razno ARID
(1A , 1B , 2 , 3A , 3B , 4A ) • CAP • IFI
(16 , 35 ) • MLL (2 , 3 , T1 ) • MNDA • NFY
(A , B , C ) • Ro /Sigma
vidi isto
transkripcioni faktor/koregulator nedostataka B bsyn : dnk (
repl ,
cycl ,
reco ,
repr )
· tscr (
fact ,
tcrg ,
nucl ,
rnat ,
rept ,
ptts )
· tltn (
risu ,
pttl ,
nexn )
· dnab ,
rnab /
runp · stru (
domn ,
1° ,
2° ,
3° ,
4° )