Синтија Никсон је јединица Ане Елизабете и Валтера Млађег Никсона, енглеског и немачког порекла.[2] Синтијини родитељи су се развели када је имала 6 година. Завршила је средњу школу Хантер, а затим је похађала Бернард колеџ. Такође је похађала студије у иностранству 1986. године.
Од 1998. до 2003. године Синтија је била у вези са школским учитељем Денијем Мозесом.[3] Имају двоје деце, ћерку Саманту и сина Чарлса Изикиела.[4]
Синтија је почела да се виђа са Кристином Маринони 2004. године.[5] Вериле су се у априлу 2009. године, а венчале 27. маја 2012. у Њујорку. Никсонова је тада носила бледо зелену хаљину Каролине Херере.[6] Маринони је родила сина, Макса Елингтона 2011. године.
Поводом њене сексуалне оријентације, Никсонова је изјавила: „Заиста не осећам да сам се променила. Била сам са мушкарцима цео живот и нисам се никад заљубила у жену. Али када се то десило, није деловало чудно. Ја сам само жена заљубљена у другу жену.”[5] Године 2012. изјавила је да је бисексуалка.[7] Никсонова се залаже и подржава истополне бракове у Вашингтону, Маринонином родном граду.
У октобру 2006. године Никсоновој је дијагностикован рак дојке током рутинског мамографског прегледа. У почетку није желела јавно да говори о томе, али је у априлу 2008. године у интервјуу за магазин Добро јутро, Америко најавила борбу са овом болешћу.[8] Од тада је постала активисткиња у борби против рака.
.jpg)
