Vznik Magistrátu upravuje § 14 zákona č. 377/1990 Zb. o hlavnom meste SR Bratislave,[1] ktorého dva odseky znejú:
(1) Odborné, administratívne a organizačné práce súvisiace s plnením úloh orgánov Bratislavy plní magistrát Bratislavy. Magistrát sa vnútorne člení na oddelenia a referáty. Organizáciu magistrátu Bratislavy, náplne činností útvarov magistrátu Bratislavy a počet zamestnancov magistrátu Bratislavy ustanovuje organizačný poriadok magistrátu Bratislavy, ktorý vydá primátor.
(2) Na čele magistrátu Bratislavy je riaditeľ, ktorého na dobu neurčitú vymenúva a odvoláva primátor. Riaditeľ magistrátu sa zúčastňuje zasadnutí mestskej rady a mestského zastupiteľstva s hlasom poradným.
Jeho rámcovú náplň určuje článok 15 Štatútu hlavného mesta SR Bratislavy:[2]
(1) Magistrát vykonáva odborné, administratívne a organizačné práce súvisiace s plnením
úloh mestských orgánov, najmä
zabezpečuje písomnú agendu mestských orgánov a orgánov mestského zastupiteľstva; je podateľňou a výpravňou písomností Bratislavy,
zabezpečuje odborné podklady a iné písomnosti na rokovanie mestského zastupiteľstva, mestskej rady a komisií mestského zastupiteľstva,
vypracúva písomné vyhotovenia všetkých rozhodnutí primátora vydaných v správnom konaní,
vykonáva nariadenia Bratislavy, uznesenia mestského zastupiteľstva a rozhodnutia primátora,
usmerňuje po odbornej a metodickej stránke rozpočtové organizácie a príspevkové organizácie a zariadenia Bratislavy,
zabezpečuje plnenie úloh samosprávy Bratislavy,
zabezpečuje výkon prenesenej pôsobnosti.
(2) Na čele magistrátu je riaditeľ, ktorého na dobu neurčitú vymenúva a odvoláva primátor.
Riaditeľ magistrátu najmä
riadi magistrát a organizuje jeho prácu,
sa zúčastňuje zasadnutí mestskej rady a mestského zastupiteľstva s hlasom poradným,
podpisuje spolu s primátorom zápisnice zo zasadnutia mestskej rady a mestského zastupiteľstva,
plní v rozsahu poverenia primátora úlohy v oblasti pracovnoprávnych vzťahov zamestnancov Bratislavy a vnútornej správy magistrátu,
plní ďalšie úlohy podľa rozhodnutia mestského zastupiteľstva a primátora.
Riaditeľ Magistrátu je priamo podriadený primátorovi mesta.[3] Súčasným riaditeľom je Mgr. Ctibor Koštál (2024).[4]