Današnji grad je osnovan 1742. pod imenomVilla de Nuestra Señora de las Mercedes de José de Manso del Tutuvén, po naredbi tadašnjeg guverneraGeneralne kapetanije Čile José Antonia Manso de Velasca.[3]
Od augusta1826. kad je stvorena nekadašnja Provincija Maule, je administrativni centar jednog departmana te provincije, pa mu je i ime promjenjeno u preimenovana u Villa de Cauquenes. Te iste godine u decembru dobio je status grada i današnje ime - Cauquenes.[3]