Izgradnja aerodroma za potrebe Jugoslovenskog ratnog vazduhoplovstva (JRV) počela je 1947. a završena 1951, kada je aerodrom zvanično otvoren. Namena aerodroma je bila zaštita jugoslovenske prestonice, Beograda, od moguće agresije iz vazduha. Jedinice stacionirane na Batajnici bile su 204. lovački avijacijski puk, 138. transportna avijacijska brigada, 252. lovačko-bombarderska avijacijska eskadrila, Vazduhoplovnoopitni centar (VOC), Remontni zavod „Moma Stanojlović" i Vazduhoplovnomedicinski institut (VMC).
Tokom agresije NATO-a na SRJ aerodrom je bio izložen čestim napadima NATO avijacije. Napadnut je 25 puta i teško je oštećen. 6. juna 2019. godine aerodrom je preimenovan iz Vojni aerodrom "Batajnica" u Vojni aerodrom pukovnik-pilot Milenko Pavlović, a 2. avgusta 2019. prilikom obeležavanja Dana roda avijacije svečano je otkrivena i tabla s novim nazivom aerodroma.
Vojna upotreba
Danas se na vojnom aerodromu pukovnik-pilot Milenko Pavlović od jedinica V i PVO nalazi 204. avijacijska baza koja je nastala objedinjavanjem svih jedinica vazduhoplovstva koje su bile bazirane na Batajnici. Na aerodromu se takođe nalazi Centar za obuku pripadnika V i PVO kao i Sektor za letna ispitivanja (bivši VOC) Tehničko-opitnog centra (TOC). Na Batajnici se nalazi oko 45 Migova 21, 25 Super Galebova, 22 Utvi, 4 Migova 29 kao i izvestan broj transportnih aviona (An-26, An-2 JAK-40) i helikoptera (Gazela, Mi-8, Mi-24, Mi-17,).
Budućnost aerodroma
Nedavno je iz Ministarstva odbrane rečeno da je druga pista koja je bila veoma oštećena popravljena i da će jedan deo aerodroma uskoro biti ograničeno otvoren za civilnu upotrebu.
Pristup aerodromu
Do aerodroma se može doći autobuskom linijom 706E (Zemun (Kej oslobođenja) - Aerodrom Batajnica).