Был одним из главных противников унииЛитвы с Польшей. Возглавляя литовскую делегацию на сейме в Люблине в 1569, успешно воспрепятствовал простому присоединению ВКЛ к Польше, пытался также не допустить перехода Волыни и Киевщины в состав Польши.
После смерти не оставившего потомка короля и великого князя Сигизмунда II Августа в 1572 Ян Ходкевич предлагался к избранию королём, выступал против кандидатуры Ивана Грозного на литовский и польский престолы, поддерживал кандидатуру Генриха Валуа.
В 1575 вместе с группой польских и литовских магнатов высказывался за избрание на трон Речи Посполитой представителя ГабсбурговМаксимилиана II.
Предположительно с 1550-х являлся приверженцем лютеранства (ср., его отец Иероним Ходкевич, будучи вначале католиком, лютеранином стал в 1553 году[1]), но в 1572 вернулся в католичество.
Семья
Был женат на Кристине Зборовской (ум. в 1588), младшей дочери каштелянакраковскогоМартина Зборовского (1492—1565) и Анны Конарской (ок. 1499—1575). Имел в этом браке трёх сыновей и четырех дочерей: