С 1908 года был учителем в русско-татарском училище в городе Мамадыше, с 1918 года — в учебных заведениях Казани.
В 1929—1964 годах преподавал в Казанском государственном педагогическом институте. Являлся учеником и последователем профессора В. А. Богородицкого. Сделал первые переводы научных трудов В. А. Богородицкого на татарский язык. С 1930 по 1949 годы был заведующим кафедрой татарского языка Казанского государственного педагогического института.
Исторически профессор М. А. Фазлуллин — основатель и первый заведующий кафедрой татарского языка в вузах страны.
Участник реформ татарской письменности, автор первого букваря на основе латинского алфавита (1929).
М. А. Фазлуллин внёс большой вклад в становление и развитие казанского журнала «Магариф» («Просвещение»). Это был первый советский педагогический журнал на татарском языке, систематически освещавший проблемы в области народного образования.
Умер в Казани в 1964 году.
Научное и педагогическое наследие
Труды по татарской филологии, истории татарской письменности, методике преподавания татарского языка в татарской школе[2].