Другое крупное собрание А. Маркова, опубликованные в Москве в 1906—1909 годах — «Материалы, собранные в Архангельской губернии летом 1901 года» (ч. 1—2, совместно Б. Богословским).
В своем тяготении к северному эпосу фольклорист обнаружил пристрастие к романтизированному Великому Новгороду, который он противопоставлял как республику самодержавной Москве XVI—XVII веков. С таким пониманием истории А. Марков связывал судьбы и идейную эволюцию эпоса: «Поэзия Великого Новгорода и её остатки в северной России» (1909), «Обзор трудов В. Ф. Миллера по народной словесности» (1916).
Внес значительный вклад в исследование былин. Дал блестящие образцы соотнесений этнических сюжетов с русскими историческими событиями и историческими лицами — при опоре на тщательное сравнительное изучение всех вариантов, при внимательном учёте многовековых традиций самого восточнославянского фольклора и возможных «внешних» воздействий — как иноэтнических фольклорных материалов, так и средневековой литературы. Исследование историзма эпических памятников во всей сложности и многосторонности их связей с источниками, характерное вообще для исторической школы В. Ф. Миллера, получило у А. В. Маркова, наиболее результативные воплощения. Эпосоведческие труды А. В. Маркова внесли существенный вклад в изучение не только былин, но и духовных стихов.
Марков отстаивал историко-социологическое направление в изучении былин, противопоставляя его «историко-бытовому» (статья «К вопросу о методе исследования былин», 1907). Несмотря на демократические устремления, не преодолел существенные недостатки исторической школы.
Беломорские былины, записанные А. Марковым. — М., 1901
Былинная традиция на Зимнем берегу Белого моря. — М., 1901
Бытовые черты русских былин. — М.: т-во скоропеч. А. А. Левенсон, 1904. — [4], 97 с.
Из истории русского былевого эпоса. — Вып. 1—2. — М.: Т-во скоропеч. А. Г. Левенсон, 1905—1907.
Из истории русского былевого эпоса. — 2-е изд. — М.: URSS, cop. 2016. — 157, [1] с. — ISBN 978-5-9710-3144-4.
Материалы, собранные в Архангельской губернии летом 1901 года А. В. Марковым, А. Л. Масловым и Б. А. Богословским. — М.: Тип. К. Л. Меньшова, 1905 (обл. 1909)—1908 (обл. 1909).