Бета-цилиндр

18-нитевой β-цилиндр. Бактериальный сахарозоспецифически йпорин из S. typhimurium. Он расположен в мембране и позволяет сахарозе диффундировать через нее. (PDB 1A0S)
8-нитевой β-цилиндр. Человеческий ретинол-связывающий белок, связанный с ретинолом (витамином А) в синем цвете.(PDB 1RBP)

β-цилиндр — разновидность третичной структуры белков; β-складчатый слой, свернутый с образованием замкнутой структуры, в которой первая цепь водородными связями связана с последней. Как правило, β-цепи в β-цилиндрах расположены в антипараллельной ориентации. Чаще всего β-цилиндры формируют такие белки, как порины и другие пронизывающие мембраны белки, и белки, связывающие внутри цилиндра гидрофобные лиганды, такие как липокалины. Примерно 2-3 % генов в грамотрицательных бактериальных геномах кодируют бета-цилиндры[1].

Во многих случаях пряди содержат чередующиеся неполярные (гидрофильные и гидрофобные) аминокислоты, так что гидрофобные остатки ориентированы во внутреннюю часть цилиндра с образованием гидрофобного ядра, а полярные остатки ориентированы наружу цилиндра на открытой для растворителя поверхности. Порины и другие мембранные белки, содержащие бета-цилиндры, меняют эту картину, причем гидрофобные остатки ориентированы наружу, где они контактируют с окружающими липидами, а гидрофильные остатки ориентированы к водной внутренней поре.

Все бета-цилиндры можно классифицировать по двум целочисленным параметрам: число прядей в бета-листе, n, и «число сдвига», S, мера колебания цепей в бета-листе[2]. Эти два параметра (n и S) связаны с углом наклона бета-нитей относительно оси ствола[3][4][5].

См. также

Примечания

  1. ↑ William C Wimley. The versatile β-barrel membrane protein (англ.) // Current Opinion in Structural Biology. — 2003-08. — Vol. 13, iss. 4. — P. 404–411. — doi:10.1016/S0959-440X(03)00099-X. Архивировано 4 октября 2021 года.
  2. ↑ Alexey G. Murzin, Arthur M. Lesk, Cyrus Chothia. Principles determining the structure of β-sheet barrels in proteins I. A theoretical analysis (англ.) // Journal of Molecular Biology. — 1994-03. — Vol. 236, iss. 5. — P. 1369–1381. — doi:10.1016/0022-2836(94)90064-7. Архивировано 25 мая 2021 года.
  3. ↑ Alexey G. Murzin, Arthur M. Lesk, Cyrus Chothia. Principles determining the structure of β-sheet barrels in proteins II. The observed structures (англ.) // Journal of Molecular Biology. — 1994-03. — Vol. 236, iss. 5. — P. 1382–1400. — doi:10.1016/0022-2836(94)90065-5. Архивировано 25 мая 2021 года.
  4. ↑ Wei-min Liu. Shear numbers of protein β-barrels: definition refinements and statistics 1 1Edited by J. M. Thornton (англ.) // Journal of Molecular Biology. — 1998-01. — Vol. 275, iss. 4. — P. 541–545. — doi:10.1006/jmbi.1997.1501. Архивировано 14 октября 2019 года.
  5. ↑ Steven Hayward, E. James Milner-White. Geometrical principles of homomeric β-barrels and β-helices: Application to modeling amyloid protofilaments: HAYWARD and MILNER-WHITE (англ.) // Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. — 2017-10. — Vol. 85, iss. 10. — P. 1866–1881. — doi:10.1002/prot.25341. Архивировано 4 августа 2021 года.

Дальнейшее чтение

  • Branden, Carl. Introduction to protein structure / Carl Branden, John Tooze. — 2nd. — New York : Garland Pub., 1999. — ISBN 978-0-8153-2304-4.
  • Michalik M, Orwick-Rydmark M, Habeck M, Alva V, Arnold T, Linke D (2017). "An evolutionarily conserved glycine-tyrosine motif forms a folding core in outer membrane proteins". PLOS ONE. 12 (8): e0182016. Bibcode:2017PLoSO..1282016M. doi:10.1371/journal.pone.0182016. PMC 5542473. PMID 28771529.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  • Hayward S, Milner-White EJ (October 2017). "Geometrical principles of homomeric β-barrels and β-helices: Application to modeling amyloid protofilaments" (PDF). Proteins. 85 (10): 1866—1881. doi:10.1002/prot.25341. PMID 28646497.

Read other articles:

Gutila

Gutila Lethrinus laticaudis Status konservasiRisiko rendahIUCN16720029 TaksonomiKerajaanAnimaliaFilumChordataKelasActinopteriOrdoSpariformesFamiliLethrinidaeGenusLethrinusSpesiesLethrinus laticaudis Tata namaSinonim takson Lethrinus fletus Whitley, 1943 Lethrinus anarhynchus Postel, 1965 lbs Lethrinus laticaudis, ikan gutila adalah spesies kaisar yang berasal dari Samudra Pasifik bagian barat di mana mereka hidup di terumbu karang pada kedalaman 5 hingga 35 meter (16 hingga 115 ft) . Rem...

 

The Maze (novel)

For other books with a similar title, see Maze (disambiguation) § Books. This article has multiple issues. Please help improve it or discuss these issues on the talk page. (Learn how and when to remove these template messages) The topic of this article may not meet Wikipedia's notability guideline for books. Please help to demonstrate the notability of the topic by citing reliable secondary sources that are independent of the topic and provide significant coverage of it beyond a mere tr...

 

Boeing C-135 Stratolifter

Boeing C-135 Stratolifter adalah pesawat angkut yang berasal dari prototipe pesawat jet Boeing 367-80 (juga dasar bagi 707 ) pada awal 1950-an. Pesawat memiliki badan sempit dan lebih pendek dari 707. Boeing memberikan pesawat penunjukan internal Model 717. Sejak pertama dibangun pada bulan Agustus 1956, C-135 telah menjadi perlengkapan yang terlihat dari Angkatan Udara Amerika Serikat . Referensi lbsPesawat militer BoeingDaftar pesawat militer Boeing Pesawat tempur/serang PW-9/FB F2B F3B F4...

Setúbal

Setúbal city of Portugalmunisipalitas di Portugalkota besardaerah pemilihan Tempat Negara berdaulatPortugalDistrik di PortugalDistrik Setúbal Ibu kota dariDistrik Setúbal NegaraPortugal Pembagian administratifSetubal (São Julião, Nossa Senhora da Anunciada e Santa Maria da Graça) São Sebastião Sado Azeitão (São Lourenço e São Simão) Gâmbia – Pontes – Alto da Guerra PendudukTotal123.496  (2021 )GeografiLuas wilayah230,33 km² [convert: unit tak dikenal]Dekat dengan ...

 

Annexions de l'Alsace-Lorraine

L'Alsace et la Lorraine, territoires du Saint-Empire romain germanique situés entre la Meuse et le Rhin, ont été annexés par le royaume de France entre les XVIe et XVIIIe siècles. Une partie de ces mêmes territoires (appelé confusément « Alsace-Lorraine » dans son ensemble), a fait l'objet d'un rattachement à l'Empire allemand au XIXe siècle, puis au Troisième Reich au XXe siècle, avant de redevenir français à la fin de la Seconde Guerre mondia...

 

Familiar Wife

A romantic fantasy South Korean television series Familiar WifePromotional posterAlso known asWife That I KnowWife I KnowHangul아는 와이프Literal meaningKnowing WifeRevised RomanizationAneun Waipeu GenreRomanceFantasyDramaComedyCreated byStudio Dragon[1]Written byYang Hee-sungDirected byLee Sang-yeobStarringJi SungHan Ji-minJang Seung-joKang Han-naCountry of originSouth KoreaOriginal languageKoreanNo. of episodes16ProductionExecutive producersCho Hyung-jinKim Sang-heonCamera setu...

Necao II

Necao II Faraón de la Dinastía XXVI de Egipto Estela de Necao II, dedicada a Isis y OsirisReinado 610 - 595 a. C.Predecesor Psamético ISucesor Psamético IIFamiliaPadre Psamético IMadre MehetenusejetConsorte JedebarbenetHijos Psamético II[editar datos en Wikidata] Uahemibra Nekau, también llamado Necao II, fue un faraón de la dinastía XXVI que gobernó en el antiguo Egipto de 610 a 595 a. C. Necao II llevó a cabo una serie de proyectos de construcción e...

 

Hières-sur-Amby

Pour les articles homonymes, voir Hyères (homonymie) et Amby. Pour l’article ayant un titre homophone, voir Yerres. Hières-sur-Amby Vue du village depuis le site archéologique de Larina. Administration Pays France Région Auvergne-Rhône-Alpes Département Isère Arrondissement La Tour-du-Pin Intercommunalité Communauté de communes Les Balcons du Dauphiné Maire Mandat Jean-Pierre Marcel 2020-2026 Code postal 38118 Code commune 38190 Démographie Populationmunicipale 1 149 h...

 

哈萨克斯坦总统

此条目序言章节没有充分总结全文内容要点。 (2019年3月21日)请考虑扩充序言，清晰概述条目所有重點。请在条目的讨论页讨论此问题。 哈萨克斯坦總統哈薩克總統旗現任Қасым-Жомарт Кемелұлы Тоқаев卡瑟姆若马尔特·托卡耶夫自2019年3月20日在任任期7年首任努尔苏丹·纳扎尔巴耶夫设立1990年4月24日（哈薩克蘇維埃社會主義共和國總統） 哈萨克斯坦 哈萨克斯坦政府...

نادي القوارة

  لمعانٍ أخرى، طالع القوارة (توضيح). نادي القوارة الأسماء السابقة الحصان الألوان البني و الأبيض تأسس عام 2014 م الملعب القوارة  السعودية البلد السعودية  الدوري دوري الدرجة الثالثة السعودي الإدارة المالك الهيئة العامة للرياضة الطقم الأساسي الطقم الاحتياطي تعديل مص...

 

Samuel Dumoulin

Samuel Dumoulin Samuel Dumoulin al Grand Prix de Denain 2015 Nazionalità  Francia Altezza 159 cm Peso 56 kg Ciclismo Specialità Strada Termine carriera 2019 CarrieraSquadre di club 2000-2001VC Lyon-Vaulx-en-Velin2001 Française des Jeuxstagista2002-2003 Jean Delatour2004-2007 AG2R Prévoyance2008-2012 Cofidis2013-2019 AG2R La MondialeNazionale 2003-2018 FranciaCarriera da allenatore 2020-2022 B&B Hotels Statistiche aggiornate al 29 gennaio 2023 Mo...

 

Goa, Daman and Diu

Former union territory of the Republic of India Goa, Daman and DiuGoem, Damanv ani Diu (Konkani)Goa, Damão e Dio (Portuguese)1961–1987 Coat of arms Goa, Daman and Diu in IndiaStatusUnion TerritoryCapitalPanjimCommon languagesKonkaniGujaratiMarathiIndo-PortuguesePortugueseLieutenant Governor • 1961-62 (first) Maj Gen K. P. Candeth (Military Governor)• 1984-87 (last) Gopal Singh Chief Minister • 1963-66 (first) Dayanand Bandodkar• 1985-87 ...

Hermandad de la Santa Cruz (Málaga)

Seráfica Hermandad de la Santa Cruz, Santísimo Cristo de la Victoria y Nuestra Señora de los Dolores en su Amparo y Misericordia. Nuestra Señora de los Dolores en su Amparo y MisericordiaLocalizaciónPaís  EspañaLocalidad MálagaSede canónica Parroquia de la Santa Cruz y San Felipe Neri[1]​Datos generalesCasa de Hermandad C/ Julio Mathias, 9 local 3.[1]​Fundación 1984[1]​Titulares Nuestra Señora de los Dolores en su Amparo y Misericordia Santísimo Cristo ...

 

John B. Anderson

American politician (1922–2017) For the American general, see John B. Anderson (United States Army officer). John B. AndersonPortrait by Bernard Gotfryd, 1980Chair of the House Republican ConferenceIn officeJanuary 3, 1969 – June 8, 1979LeaderGerald Ford(1969–1973)John Jacob Rhodes(1973–1979)Preceded byMelvin LairdSucceeded bySamuel L. DevineMember of the U.S. House of Representativesfrom Illinois's 16th districtIn officeJanuary 3, 1961 – January 3, 198...

 

Gustave Loiseau

French painter Gustave Loiseau: Port de Dieppe (1926) Gustave Loiseau (3 October 1865 – 10 October 1935) was a French Post-Impressionist painter, remembered above all for his landscapes and scenes of Paris streets.[1] Early life Loiseau was born in Paris and was brought up there, and at Pontoise, by parents who owned a butchers shop. He served an apprenticeship with a decorator who was a friend of the family. In 1887, when a legacy from his grandmother allowed him to concentrate on ...

مضلع متساوي الأضلاع

  ميّز عن مضلع منتظم. في الهندسة، مضلع متساوي الأضلاع (بالإنجليزية: Equilateral polygon)‏ هو مضلع جميع أضلاعه متساوية في القياس كما يدل على ذلك اسمه.[1][2] إذا تساوت الأضلاع وتساوت الزوايا، فإن هذا المضلع يصير مضلعا منتظما. أمثلة سداسي متساوي الأضلاع مقعر أو ذاتي التقاطع �...

 

Pesello

Ritratto di Pesello nelle Vite di Vasari Giuliano d'Arrigo, detto il Pesello (Firenze, 1367 – Firenze, 6 aprile 1446), è stato un pittore italiano. Indice 1 Biografia 2 Bibliografia 3 Altri progetti 4 Collegamenti esterni Biografia La sua figura, nota dalle fonti antiche, è piuttosto oscura, nonostante si conoscano alcuni documenti che lo riguardano, ricostruiti da Ugo Procacci nel 1960. Si sa che nel 1416 aveva costituito una compagnia di pittori e che nel 1420 fu tra i partecipanti al c...

 

Emil Knoevenagel

Heinrich Emil Albert Knoevenagel Heinrich Emil Albert Knoevenagel (Hannover, 18 giugno 1865 – Berlino, 11 agosto 1921) è stato un chimico tedesco i cui studi spaziarono dall'ambito della chimica fisica a quello della chimica organica ed inorganica. Studiò ad Hannover e successivamente divenne assistente di Viktor Meyer seguendolo prima a Gottinga e successivamente a Heidelberg, dove nel 1892 ottenne l'abilitazione alla docenza universitaria. Dal 1896 iniziò ad insegnare a Heidelberg. I s...

Emby

Not to be confused with Enby. Media server software EmbyDeveloper(s)Emby TeamStable release4.7.12.0 / 23 May 2023; 14 months ago (2023-05-23)[1]Preview release4.8.0.47-beta / 20 September 2023; 10 months ago (2023-09-20)[1] Repositorygithub.com/MediaBrowser/Emby.ReleasesWritten inC#Operating systemCross platformPlatform Server:macOS, Windows, Linux, FreeBSD, Nvidia Shield TV, Synology Disk Manager, Netgear, QNAP, Unraid, Drobo, ASUStor, Thec...

 

Rhydderch Hael

Rhydderch HaelPierre Clochoderick Rocking située dans le Renfrewshire, censée marquer la sépulture de Rhydderch HaelFonctionRoi de StrathclydeBiographieNaissance Royaume de StrathclydeDécès 614Père Tutagual d'Alt ClutEnfant Constantin de Strathclyde (?)Autres informationsPropriétaire de Dyrnwyn (d)modifier - modifier le code - modifier Wikidata Rhydderch Hael de Strathclyde (mort vers 600) est un roi de Strathclyde actif vers 570-600. Origine La généalogie du roi Rhydderch surnommé ...