Территория заповедника состоит из двух кластерных участков — «Барсакельмес» и «Каскакулан».
Участок «Барсакельмес» включает в себя прежнюю территорию заповедника (16 975 га) и осушенное дно озера, общая площадь 50 884 га (из них заповедное ядро — 37 725 га, буферная зона — 13 159 га). Участок «Каскакулан» занимает 109 942 га (заповедное ядро — 68 154 га, буферная зона — 41 788 га).
1983 г. — на острове обитает 230 сайгаков, 160 джейранов, 242 кулана.
2005 г. — в районе Каскакулана насчитывается 179 куланов, на полуострове Барсакельмес — 155 сайгаков и 50 джейранов.
2009 г. — Барсакельмес перестал быть полуостровом; с тех пор представляет собой урочище, со всех сторон окружённое осушенным морским дном.
В марте 2016 года заповедник включён во Всемирную сеть биосферных заповедников ЮНЕСКО[1].
Флора и фауна
Флора сосудистых растений заповедника включает 278 видов, в том числе эндемичные казахстанские виды: полынь (аральская и прутьевидная), лебеда Пратова, жузгуны (курчеватый, приземистый, Талибина), тюльпан Борщова.
Исмагилов М. И. Остров куланов: Заповедник Барса-Кельмес / Переплёт и оформление: Ю. М. Сапожникова. — Алма-Ата: Кайнар, 1973. — 120, [40] с. — (Человек и природа). — 45 000 экз.
Заповедники Средней Азии и Казахстана / В. Е. Соколов, Е. Е. Сыроечковский. — М.: «Мысль», 1990. — 400 с. — 100 000 экз. — ISBN 5-244-00273-2.