Diaphoretickes

Diaphoretickes
Научная классификация
Домен:
Эукариоты
Клада:
Diaphoretickes
Международное научное название
Diaphoretickes Adl et al., 2012
Синонимы
Дочерние таксоны

Diaphoretickes (лат.) — обширная клада эукариот. Группа включает архепластид (Archaeplastida), страменопил (Stramenopiles), альвеолят (Alveolata) и ризарий (Rhizaria), а также ряд других эукариот. Страменопилы, альвеоляты и ризарии объединяются в кладу Sar, получившую своё имя по первым буквам названий включённых в неё таксонов[1].

Клада Diaphoretickes введена в систематику эукариот Синой Адлом и соавторами в 2012 году[1]. В классификации Томаса Кавалье-Смита и соавторов (2015) та же самая эволюционная группа описывается как надцарство кортикаты[2] (лат. Corticata), включающее два царства: хромисты (Chromista) и растения (Plantae; в объёме Archaeplastida)[3]. По версии Кавалье-Смита, название Diaphoretickes следует считать младшим синонимом таксона Corticata, имеющего более продолжительную историю использования[3][4].

Определение

Адл и соавторы (2012) определили Diaphoretickes как наиболее инклюзивную кладу, включающую Bigelowiella natans Moestrup & Sengco, 2001 (Rhizaria), Tetrahymena thermophila Nanney & McCoy, 1976 (Alveolata), Thalassiosira pseudonana Cleve, 1873 (Stramenopiles) и Arabidopsis thaliana (Linnaeus) Heynhold, 1842 (Archaeplastida), но не Homo sapiens Linnaeus, 1758 (Opisthokonta), Dictyostelium discoideum Raper, 1935 (Amoebozoa) и Euglena gracilis Klebs, 1883 (Excavata). Название Diaphoretickes происходит от др.-греч. διαφορετικές [diaforetikés] — «разнообразный, различный», и относится к морфологическому разнообразию и различиям по основным клеточным характеристикам, возникшим у представителей этой клады после происхождения от общего предка[1].

Согласно Кавалье-Смиту и соавторам (2015), филогенетически надцарство Corticata объединяет всех потомков общего предка растения Arabidopsis и инфузории Paramecium. Название группы происходит от лат. cortex — «кора, кожура», и отсылает к укреплённому внешнему слою клетки, характерному для многих кортикат[3][5].

Филогения

Ниже приведена кладограмма, составленная Bonacolta et al. (2023) на основе базы данных EukProt[6], впервые представленной Richter et al. (2022). В оригинальном анализе Richter et al. (2022) род Ancoracysta помещён в состав Haptista, тогда как Hemimastigophora находятся в политомии[англ.] со всеми основными ветвями эукариот[7].

Strassert et al. (2019) предложили название TSAR для обозначения клады, включающей Telonemia и Sar (Stramenopiles, Alveolata и Rhizaria)[8]. Yazaki et al. (2022) выделили кладу CAM, названную так по первым буквам включённых в неё таксонов: Cryptista, Archaeplastida и Microheliella[англ.]. Язаки и соавторы выделили также кладу Pancryptista в составе CAM, включающую Cryptista и Microheliella, которые, согласно их анализу являются сестринскими таксонами[9]. В исследовании Tikhonenkov et al. (2022) род Ancoracysta, а также описанные в той же публикации роды Nebulomonas, Nibbleromonas и Ubysseya[англ.], были выделены в новую супергруппу эукариот под названием Provora, включённую в состав Diaphoretickes[10].

Следующая кладограмма приведена в последней системе эукариот Кавалье-Смита, опубликованной уже после его смерти, в 2022 году (Cavalier-Smith, 2022). Названия клад, написанные со строчной буквы, предлагалось использовать в качестве нетаксономических. По версии Кавалье-Смита, хромисты (Chromista) являются монофилетической группой, включающей SAR, Telonemia, Haptista и Cryptista[4], что идёт вразрез с данными другим исследователей, свидетельствующими в пользу родства криптист и архепластид (растений в широком смысле)[2][9].

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 Adl S. M., Simpson A. G., Lane C. E., et al. The Revised Classification of Eukaryotes (англ.) // Journal of Eukaryotic Microbiology : journal. — 2012. — Vol. 59, iss. 5. — P. 429—514. — ISSN 1066-5234. — doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x.
  2. ↑ 1 2 Змитрович И. В., Перелыгин В. В., Жариков М. В. Последняя система Кавалье-Смита // Формулы Фармации : журнал. — 2024. — Т. 6, № 2. — С. 68—77. — ISSN 2713-153X. — doi:10.17816/phf633981.
  3. ↑ 1 2 3 Cavalier-Smith T., Chao E. E., Lewis R. Multiple origins of Heliozoa from flagellate ancestors: New cryptist subphylum Corbihelia, superclass Corbistoma, and monophyly of Haptista, Cryptista, Hacrobia and Chromista (англ.) // Molecular Phylogenetics and Evolution : journal. — 2015. — Vol. 93. — P. 331—362. — ISSN 1055-7903. — doi:10.1016/j.ympev.2015.07.004. — PMID 26234272.
  4. ↑ 1 2 Cavalier-Smith T. Ciliary transition zone evolution and the root of the eukaryote tree: implications for opisthokont origin and classification of kingdoms Protozoa, Plantae, and Fungi (англ.) // Protoplasma : journal. — 2022. — Vol. 259, iss. 3. — P. 487—593. — ISSN 0033-183X. — doi:10.1007/s00709-021-01665-7. — PMID 34940909. — PMC 9010356.
  5. ↑ Сергей Ястребов (2018-04-17). "Выделена новая супергруппа эукариот". Элементы.ру. Архивировано 14 декабря 2023. Дата обращения: 27 сентября 2024.
  6. ↑ Bonacolta A. M., Weiler B. A., Porta-Fitó T., Sweet M., Keeling P., del Campo J. Beyond the Symbiodiniaceae: diversity and role of microeukaryotic coral symbionts (англ.) // Coral Reefs : journal. — 2023. — Vol. 42, iss. 2. — P. 567—577. — ISSN 1432-0975. — doi:10.1007/s00338-023-02352-0.
  7. ↑ Richter D. J., Berney C., Strassert J. F. H., Poh Y.-P., Herman E. K., Muñoz-Gómez S. A., Wideman J. G., Burki F., de Vargas C. EukProt: A database of genome-scale predicted proteins across the diversity of eukaryotes (англ.) // Peer Community Journal : journal. — 2022. — Vol. 2. — P. e56. — ISSN 2804-3871. — doi:10.24072/pcjournal.173.
  8. ↑ Strassert J. F. H., Jamy M., Mylnikov A. P., Tikhonenkov D. V., Burki F. New Phylogenomic Analysis of the Enigmatic Phylum Telonemia Further Resolves the Eukaryote Tree of Life (англ.) // Molecular Biology and Evolution : journal. — 2019. — Vol. 36, iss. 4. — P. 757—765. — ISSN 0737-4038. — doi:10.1093/molbev/msz012. — PMID 30668767. — PMC 6844682.
  9. ↑ 1 2 3 Yazaki E., Yabuki A., Imaizumi A., Kume K., Hashimoto T., Inagaki Y. The closest lineage of Archaeplastida is revealed by phylogenomics analyses that include Microheliella maris (англ.) // Open Biology : journal. — 2022. — Vol. 12, iss. 4. — ISSN 2046-2441. — doi:10.1098/rsob.210376. — PMID 35414259. — PMC 9006020.
  10. ↑ 1 2 Tikhonenkov D. V., Mikhailov K. V., Gawryluk R. M. R., Belyaev A. O., Mathur V., Karpov S. A., Zagumyonnyi D. G., Borodina A. S., Prokina K. I., Mylnikov A. P., Aleoshin V. V., Keeling P. J. Microbial predators form a new supergroup of eukaryotes (англ.) // Nature : journal. — 2022. — Vol. 612, iss. 7941. — P. 714—719. — ISSN 1476-4687. — doi:10.1038/s41586-022-05511-5. — Bibcode: 2022Natur.612..714T. — PMID 36477531.