В 2004 году, после банкротства авиакомпании Эйр Казахстан, Atyrau Airways, совместно с авиакомпаниями SCAT и Саяхат заняла освободившиеся внутренние маршруты[5].
13 июля 2009 года авиакомпания Atyrau Airways была включена в список авиаперевозчиков, запрещённых в Европейском Союзе
В октябре 2009 года правительство Казахстана приостановило действие сертификатов эксплуатанта авиакомпаний Pankh Center Kazakhstan, Air Flamingo, Arkhabay, Turgay Avia и Atyrau Airways. В итоге авиакомпания Atyrau Airways прекратила свою деятельность[4][6][7].