Ягелло́нский университе́т (пол.Uniwersytet Jagielloński, лат.Universitas Jagellonica Cracoviensis) или Краковский университет — высшее учебное заведение в Кракове, древнейшее и одно из самых крупных в Польше, одно из старейших в Европе.
Грамота об основании университета была издана 12 мая 1364 года Казимиром III. Было создано одиннадцать кафедр: восемь правоведческих, две медицинские и одна — свободных искусств. На создание кафедры богословия тогда ещё не было получено разрешения папы. Главой университета, призванным заботиться о его деятельности и дальнейшем развитии, стал канцлеркоролевства. Были начаты организационные и строительные работы. Однако они приостановились после смерти короля, а период правления Людовика Венгерского оказался для развития университета не самым благоприятным.
26 июля 1400 года король Польши и великий князь Литовский Владислав Ягелло, благодаря пожалованиям королевы Ядвиги, возобновил деятельность университета (чем и объясняется его название — Ягеллонский университет), что имело особое значение не только для Польши но и для великого княжества Литовского (ещё не были основаны ни Кёнигсбергский (1544) ни Виленский университеты (1579). Краковский университет был главной высшей школой для молодёжи из княжества. Ягелло оказывал поддержку литвинам, обучавшимся в университете: в 1409 г. он поручил выделить дом для размещения бедных студентов, особенно тех, которые «прибыли из Литвы и Руси». До середины XV в. в Краковском университете обучалось около 70 юношей из Литвы из мещанского сословия, а также представители шляхты (князьяГедройцы, Сапеги, Свирские, Гольшанские). А Герман, князь Гедройцкий, был назначен королевской семьёй (четвёртая жена короля ЯгеллоСофия Гольшанская была двоюродной сестрой князя Германа) попечителем Ягеллонского Университета.
Первоначально университет назывался Studium Generale,
затем Краковской академией (пол.Akademia Krakowska),
позднее Главной школой коронной (пол.Szkoła Główna Koronna).
В XIX веке получил своё нынешнее название Ягеллонского, подчёркивающее связь с династией Ягеллонов.
6 ноября 1939 года в рамках операции Sonderaktion Krakau нацистские власти арестовали и отправили в концлагерь Заксенхаузен 144 преподавателя. Во время Второй мировой войны университет был закрыт. Занятия в университете возобновились в 1945 году после занятия Кракова Красной Армией. В 1950—1954 годах несколько факультетов были преобразованы в самостоятельные университеты.
Библиотека университета — одна из крупнейших и старейших в Польше, имеет более 6 млн единиц хранения. В фондах библиотеки большая коллекция средневековых рукописей, среди которых, например, De revolutionibus orbium coelestium Коперника, Кодекс Балтазара Бехема. Здесь есть большое собрание литературы польского самиздата времена коммунистической власти (1945—1989). К библиотеке относятся фонды так называемой Берлинки, статус которой остается спорным.