Павел Юон родился 6 марта 1872 года в семье служащего страховой компании, отец которого, дед композитора, булочник, перебрался в Россию из швейцарской деревни Мазайн. Мать, по воспоминаниям самого Павла Юона, увлекалась искусством — немного пела и музицировала[6]. В силу немецко-швейцарского происхождения получил среднее образование в немецкой школе. Учился в Московской консерватории у Ивана Гржимали (скрипка), Антона Аренского и Сергея Танеева (композиция), затем совершенствовался как композитор в Берлине под руководством Вольдемара Баргиля[7][8].
Композиторское наследие Юона включает оперу «Алеко» (1896), четыре симфонии, три скрипичных концерта, тройной концерт для фортепиано, скрипки и виолончели с оркестром, широкий спектр ансамблевой, камерной и театральной музыки, песни — в общей сложности около 90 сочинений. Юону принадлежат также различные аранжировки и переложения, преимущественно для фортепиано. На немецкий язык он перевёл учебники Аренского и Петра Чайковского по гармонии, а также очерк жизни и творчества П. Чайковского, написанный его братом Модестом[7]. Павел Фёдорович составил учебник на немецком языке — «Praktische Harmonielehre» (в 2 частях) и сборник задач к учебнику П. Чайковского[7][9].
Павел Фёдорович Юон умер 21 августа 1940 года в швейцарском городе Веве.
Ряд произведений Юона, особенно камерных ансамблей, были записаны — в том числе в исполнении Альтенберг-трио. В 1998 году в Цюрихе было основано Международное общество Юона, занимающееся изучением и пропагандой его творчества.