Кратер Хейнзиус имеет полигональную форму и значительно разрушен. Вал сглажен, юго-западная оконечность вала перекрыта парой сателлитных кратеров Хейнзиус B и C, в южной части чаши расположен сателлитный кратер Хейнзиус А. Упомянутые три кратера расположены так, что формируют вершины равностороннего треугольника, при этом их валы разделены всего несколькими километрами. В северо-восточной части внутреннего склона вала расположен широкий уступ. В юго-восточной части чаши находятся небольшие сателлитные кратеры Хейнзиус S и T, при этом последний расположен на внутреннем склоне вала. Остальная часть чаши кратера относительно ровная, без приметных структур, за исключением маленького кратера окруженного выброшенными породами с высоким альбедо в северо-западной части чаши. Севернее и южнее кратера Хейнзиус проходят светлые лучи от кратера Тихо, при этом породы, выброшенные при образовании последнего, отмечают вал и чашу кратера Хейнзиус.
↑ 12Lunar Impact Crater Database. Losiak A., Kohout T., O’Sulllivan K., Thaisen K., Weider S. (Lunar and Planetary Institute, Lunar Exploration Intern Program, 2009); updated by Öhman T. in 2011. Archived page.