Сен-Сатюрнен-лез-Апт расположен в 50 км к востоку от Авиньона. Соседние коммуны: Рюстрель на востоке, Виллар на юго-востоке, Гаргас на юге, Льу на западе.
Гидрография
В коммуне находится оросительное водохранилище общим объёмом 4 300 м3. Коммуну пересекает Провансальский канал. В окрестностях Сен-Сатюрнен-лез-Апт к северу от хутора Пикар берёт начало Имерг, приток Калавона.