После сокращения автономии Косово в 1989 году Ругова становится одним из создателей первой некоммунистической партии в Косово — умеренной Демократической лиги Косово. В 1992 году Ругова победил на непризнанных президентских выборах в Косово.
Ругова начал политику неповиновения федеральным институтам власти. При нём в крае была организована параллельная система общественных институтов в сферах просвещения, здравоохранения, СМИ, а также в политической сфере. Эти новые структуры почти полностью состояли из этнических албанцев.
С 1998 года его политическое влияние ослабло из-за радикализации косовских албанцев.
В 2002 и 2004 годах парламент Косово избирал Ругову президентом (Косово формально оставалось частью Сербии, но фактически с 1999 года находилось под управлением ООН).
.svg){kind=small}
