Полинтоны

Полинто́ны[1] (англ. Polintons, Mavericks[2][3]) — крупные ДНК-транспозоны, содержащие гены, гомологичные вирусным белкам; часто встречаются в эукариотических геномах. Эти наиболее крупные и сложно устроенные ДНК-транспозоны были открыты в середине 2000-х годов. Один полинтон может кодировать до 10 различных белков. Название этих мобильных элементов образовано от двух ключевых белков, которые они кодируют: ДНК-полимераза (POLymerase) и интеграза (INTegrase) ретровирусного типа (название придумали Владимир Капитонов[англ.] и Ежи Юрек[англ.])[4][5][2][6][7].

Свойства

Типичный полинтон имеет размер 15—20 тысяч пар оснований (килобаз, кб), хотя известны полинтоны размером до 40 кб[3]. Полинтоны кодируют до 10 белков, важнейшие из которых — ДНК-полимераза типа В и интеграза ретровирусного типа. Полинтоны иногда называются самосинтезирующимися транспозонами, поскольку они кодируют все белки, необходимые для собственной репликации. Большинство полинтонов также кодируют цистеиновую протеазу аденовирусного типа, FtsK-подобную АТФазу и белки, содержащие участки, гомологичные укладке jelly roll[англ.], характерной для белков вирусных капсидов. Наличие предполагаемых капсидных белков свидетельствует, что теоретически полинтоны могут в некоторых условиях формировать вирионы, в связи с чем было предложено переименовать полинтоны в полинтовирусы. Однако образование полинтонами вирионов ещё не было подтверждено экспериментально, поэтому последний термин пока не используется. Полинтоны содержат концевые инвертированные повторы[англ.], присущие мобильным элементам, которые обычно имеют размер от 100 до 1000 пар оснований[2][7][8].

Распространение

Полинтоны были выявлены во всех группах эукариот, за исключением архепластид (то есть красных водорослей, глаукофитовых водорослей, зелёных водорослей и наземных растений). Особенно полинтоны характерны для униконтов — группы эукариот, включающей животных[2]. Геном паразитического простейшего Trichomonas vaginalis, вызывающего трихомониаз, почти на 30 % состоит из полинтонов[5].

Эволюция

Генетическая сеть, соединяющая различные вирусы и эгоистичные генетические элементы (отмечены кружками). Линии, соединяющие кружки, раскрашены разными цветами в зависимости от того, на основании гомологии какого белка установлена связь[9]

Согласно ранним описаниям, полинтоны, по-видимому, являются древними мобильными элементами, которые появились по меньшей мере миллиард лет назад и имелись уже у раннего предка современных эукариот[4]. Эта гипотеза подтверждается и филогенетическим анализом последовательностей полинтонов, который также показал, что полинтоны передаются в основном вертикально[3] (хотя имеются данные и о горизонтальном переносе полинтонов[10]).

Эволюционные взаимоотношения между полинтонами, вирусами, чей геном представлен двуцепочечной ДНК (дцДНК), и эгоистичными генетическими элементами[англ.] весьма сложны. Первые исследования, основанные на изучении последовательностей, отнесли к родственникам полинтонов линейные плазмиды, бактериофаги и аденовирусы[4]. Позднее была показана эволюционная близость полинтонов, вирофагов и гигантских вирусов. Считается, что полинтоны являются компонентами сложной генетической сети, связывающей эгоистичные мобильные элементы геномов эукариот с вирусами, геномы которых представлены дцДНК. Полинтоны разделяют один или несколько гомологичных генов с линейными плазмидами, вирофагами (особенно вирофагом Мавирус[англ.]), гигантскими вирусами (порядок Megavirales), транспозонами Ginger 1 и Tlr1, трансповиронами[англ.], эукариотическими аденовирусами и бактериофагами семейства Tectiviridae[англ.][2][7][9].

Примечания

  1. ↑ Усов К. Е., Коханенко А. А., Стегний В. Н.  Сравнительный анализ состава ДНК прицентромерного гетерохроматина хромосом Drosophila orena и Drosophila virilis (Diptera: Drosophilidae) // Вестник Томского гос. ун-та. — 2013. — Т. 24, № 4. — С. 117—123. Архивировано 25 марта 2020 года.
  2. ↑ 1 2 3 4 5 Krupovic M., Koonin E. V. Polintons: a hotbed of eukaryotic virus, transposon and plasmid evolution. (англ.) // Nature reviews. Microbiology. — 2015. — Vol. 13, no. 2. — P. 105—115. — doi:10.1038/nrmicro3389. — PMID 25534808. [исправить]
  3. ↑ 1 2 3 Haapa-Paananen S., Wahlberg N., Savilahti H. Phylogenetic analysis of Maverick/Polinton giant transposons across organisms. (англ.) // Molecular phylogenetics and evolution. — 2014. — Vol. 78. — P. 271—274. — doi:10.1016/j.ympev.2014.05.024. — PMID 24882428. [исправить]
  4. ↑ 1 2 3 Kapitonov V. V., Jurka J. Self-synthesizing DNA transposons in eukaryotes. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. — 2006. — Vol. 103, no. 12. — P. 4540—4545. — doi:10.1073/pnas.0600833103. — PMID 16537396. [исправить]
  5. ↑ 1 2 Pritham E. J., Putliwala T., Feschotte C. Mavericks, a novel class of giant transposable elements widespread in eukaryotes and related to DNA viruses. (англ.) // Gene. — 2007. — Vol. 390, no. 1-2. — P. 3—17. — doi:10.1016/j.gene.2006.08.008. — PMID 17034960. [исправить]
  6. ↑ Yutin N., Shevchenko S., Kapitonov V., Krupovic M., Koonin E. V. A novel group of diverse Polinton-like viruses discovered by metagenome analysis. (англ.) // BMC biology. — 2015. — Vol. 13. — P. 95. — doi:10.1186/s12915-015-0207-4. — PMID 26560305. [исправить]
  7. ↑ 1 2 3 Krupovic M., Koonin E. V. Self-synthesizing transposons: unexpected key players in the evolution of viruses and defense systems. (англ.) // Current opinion in microbiology. — 2016. — Vol. 31. — P. 25—33. — doi:10.1016/j.mib.2016.01.006. — PMID 26836982. [исправить]
  8. ↑ Krupovic M., Bamford D. H., Koonin E. V. Conservation of major and minor jelly-roll capsid proteins in Polinton (Maverick) transposons suggests that they are bona fide viruses. (англ.) // Biology direct. — 2014. — Vol. 9. — P. 6. — doi:10.1186/1745-6150-9-6. — PMID 24773695. [исправить]
  9. ↑ 1 2 Yutin N., Raoult D., Koonin E. V. Virophages, polintons, and transpovirons: a complex evolutionary network of diverse selfish genetic elements with different reproduction strategies. (англ.) // Virology journal. — 2013. — Vol. 10. — P. 158. — doi:10.1186/1743-422X-10-158. — PMID 23701946. [исправить]
  10. ↑ Dupuy C., Periquet G., Serbielle C., Bézier A., Louis F., Drezen J. M. Transfer of a chromosomal Maverick to endogenous bracovirus in a parasitoid wasp. (англ.) // Genetica. — 2011. — Vol. 139, no. 4. — P. 489—496. — doi:10.1007/s10709-011-9569-x. — PMID 21451967. [исправить]

Read other articles:

Inghilterra

Disambiguazione – England rimanda qui. Se stai cercando altri significati, vedi England (disambigua). InghilterraNazione costitutiva(EN) England (dettagli) (dettagli) LocalizzazioneStato Regno Unito AmministrazioneCapoluogoLondra Lingue ufficialiInglese TerritorioCoordinatedel capoluogo51°18′09.36″N 0°04′26.04″E / 51.3026°N 0.0739°E51.3026; 0.0739 (Inghilterra)Coordinate: 51°18′09.36″N 0°04′26.04″E / 51.3026°N 0.0739°E...

 

Daftar jalan bebas hambatan federal di Jerman

Label Bundesstraße 7 Jerman Berikut adalah daftar jalan bebas hambatan federal di Jerman atau Bundestraßen. Bundesstraßen tidak memiliki sistem penomoran seperti yang dipakai autobahn (jalan motor) Jerman, tetapi memiliki sistem penomoran regional searah jarum jam: B 1 hingga B 10 melintasi Jerman dari perbatasan ke perbatasan B 11 hingga B 26 di Jerman Tenggara (Bayern) B 27 hingga B 39 di Jerman Barat Daya (Baden-Württemberg) B 40 hingga B 53 di Jerman Barat (Rheinland-Pfalz) B 54 hingg...

 

Biro Investigasi Pusat

Biro Investigasi Pusatकेंद्रीय अन्वेषण ब्यूरोKendriya Anveshan BureauLambang Biro Investigasi PusatNamaBiro Investigasi PusatSingkatanCBIMottoIndustri, Impartialitas, IntegritasIkhtisarDibentuk1941PendahuluPendirian Polisi Istimewa (SPE) (1941)PersonelSanctioned: 6590Actual: 5666Lowong: 924 (14%)as on 31 December 2011[1]Anggaran₹303,79 crore (US$43 juta) (2011-2012)[1]Struktur yurisdiksiLembaga federal(Yurisdiksi operasi)IndiaWi...

WT Social

Wikitribune SocialURLwt.social Tipelayanan jejaring sosial Perdagangan ?ya (didanai oleh para anggota)Registration (en)wajib (gratis)LangueMultilingualPengguna300.000 pengguna(November 2019)LisensiPerangkat lunak milik peroranganPemilikJimmy Wales PembuatJimmy Wales Service entry (en)Oktober 2019; 4 tahun lalu (2019-10)KeadaanAktif WT:Social, juga dikenal sebagai WikiTribune Social, adalah sebuah layanan jejaring sosial dan mikroblog Amerika Serikat diman para penggunanya berkontrib...

 

Raffi Ahmad

Raffi AhmadRaffi pada tahun 2020LahirRaffi Farid Ahmad17 Februari 1987 (umur 37)Bandung, Jawa Barat, IndonesiaKebangsaanIndonesiaAlmamaterSMA Negeri 16 JakartaPekerjaanAktorPembawa acaraPenyanyiPengusahaSelebritas internetProduserTahun aktif2001–sekarangDikenal atasPT RNR Film InternasionalRANS EntertainmentSuami/istriNagita Slavina ​(m. 2014)​Anak Rafathar Malik Ahmad Rayyanza Malik Ahmad Orang tuaAmy Qanita (ibu)Keluarga Nisya Ahmad (adik) Syahnaz S...

 

Roberto Rosales

Nama ini menggunakan cara penamaan Spanyol: nama keluarga pertama atau paternalnya adalah Rosales dan nama keluarga kedua atau maternalnya adalah Altuve. Roberto Rosales Rosales bermain untuk Málaga pada 2015Informasi pribadiNama lengkap Roberto José Rosales AltuveTanggal lahir 20 November 1988 (umur 35)Tempat lahir Caracas, VenezuelaTinggi 174 cm (5 ft 9 in)Posisi bermain Bek kananInformasi klubKlub saat ini LeganésNomor 16Karier junior Deportivo Gulima CaracasKar...

Jorge Antonio Serrano Elías

Questa voce sull'argomento politici guatemaltechi è solo un abbozzo. Contribuisci a migliorarla secondo le convenzioni di Wikipedia. Jorge Antonio Serrano ElíasRitratto ufficiale Presidente del GuatemalaDurata mandato14 gennaio 1991 –1º giugno 1993 Vice presidenteGustavo Adolfo Espina Salguero PredecessoreMarco Vinicio Cerezo Arévalo SuccessoreGustavo Espina Dati generaliPartito politicoMovimento di Azione e Solidarietà Firma Jorge Antonio Serrano Elías (...

 

Skadron Udara 11

Skadron Udara 11Lanud Sultan HasanuddinLambang Skadron Udara 11Dibentuk1 Juni 1957NegaraIndonesiaCabang TNI Angkatan UdaraTipe unitKomando TempurBagian dariWing Udara 5MarkasMakassar, Sulawesi SelatanJulukanSkadud 11MotoBajra Garda BhuwanaUlang tahun1 JuniPesawat Tempur OperasionalSU-27SK, SU-30MK/MK2Situs webSkadud 11 Skadron Udara 11 (atau Skadud 11) adalah sebuah skuadron udara yang dilahirkan pada 1 Juni 1957 di Lanud Andir (sekarang bernama Lanud Husen Sastranegara), Bandung, Jawa Barat....

 

Hollywood Steps Out

1941 filmHollywood Steps OutDirected bySupervision:Fred AveryStory byDave MonahanProduced byLeon SchlesingerStarringSara BernerMel BlancKent RogersEdited byTreg BrownMusic byCarl W. StallingAnimation byRod ScribnerColor processTechnicolorProductioncompanyLeon Schlesinger ProductionsDistributed byWarner Bros. PicturesRelease dates May 24, 1941 (1941-05-24) (original) October 2, 1948 (1948-10-02) (Blue Ribbon reissue) Running time7:45LanguageEnglish Hollywo...

Jack Cust

American baseball player (born 1979) Baseball player Jack CustCust with the Seattle MarinersDesignated hitter / OutfielderBorn: (1979-01-07) January 7, 1979 (age 45)Flemington, New Jersey, U.S.Batted: LeftThrew: RightMLB debutSeptember 26, 2001, for the Arizona DiamondbacksLast MLB appearanceJuly 27, 2011, for the Seattle MarinersMLB statisticsBatting average.242Home runs105Runs batted in323 Teams Arizona Diamondbacks (2001) Colorado Rockies (2002) Baltimore...

 

23 1/2 Hours' Leave

23 1/2 Hours' LeaveIklan surat kabarSutradaraHenry KingProduserThomas H. InceSkenarioMary Roberts RinehartAgnes Christine JohnstonPemeranDouglas MacLeanDoris MayTom GuiseMaxfield StanleyWade BotelerAlfred HollingsworthSinematograferBert CannPerusahaanproduksiThomas H. Ince CorporationFamous Players-Lasky CorporationDistributorParamount PicturesTanggal rilis 16 November 1919 (1919-11-16) Durasi50 menitNegaraAmerika SerikatBahasaBisu (intertitel Inggris) 23 1/2 Hours' Leave adalah sebuah f...

 

Кооперативная марка

Кооперативная паевая марка Центросоюза СССР и РСФСР (1950-е, 1 рубль) Кооперати́вные ма́рки — вид кредитных марок, выпускаемых массовыми коллективными объединениями, функционирующими в области производства и обмена, — потребительскими, снабженческо-бытовыми, креди�...

Friday Night, Saturday Morning

British TV talk show (1979–1982) Friday Night, Saturday MorningGenreTalk showCreated byIain JohnstoneWill WyattDirected byPhil Chilvers, John BurrowesPresented byNed SherrinTim RiceJane WalmsleyTheme music composerAndré JacqueminDave HowmanCountry of originUnited KingdomOriginal languageEnglishNo. of series6No. of episodes64 (list of episodes)ProductionProducersIain JohnstoneFrances WhitakerProduction locationsGreenwood Theatre, LondonOriginal releaseNetworkBBC2Release28 September 1979...

 

Foreign Account Tax Compliance Act

2010 U.S. tax law FATCA redirects here. Not to be confused with FACTA. Foreign Account Tax Compliance ActAcronyms (colloquial)FATCAEnacted bythe 111th United States CongressEffectiveMarch 18, 2010 (26 USC § 6038D); December 31, 2017 (26 USC §§ 1471-1474)CitationsPublic law111-147Statutes at Large124 Stat. 71, 97-117CodificationTitles amended26U.S.C. sections created26 U.S.C. §§ 1471–1474, § 6038DU.S.C. sections amended26 U.S.C. § 163,...

 

كوردوغلو مصلح الدين ريس

كوردوغلو مصلح الدين ريس معلومات شخصية تاريخ الميلاد 1487م الوفاة 1535مجزيرة رودس، الدولة العثمانية مواطنة الدولة العثمانية  الأولاد كوردوغلو خضر ريس  مناصب قبطان باشا   في المنصب1525  – 1530  بيرم باشا (قبطان)  دريا بك سليمان باشا  الحياة العملية المهنة ضابط بحر�...

Palazzo di Schönbrunn

Castello di SchönbrunnIl Castello di Schönbrunn dal parco nel 2014.LocalizzazioneStato Austria LocalitàVienna IndirizzoSchönbrunner Schloßstraße 47 Coordinate48°11′04.26″N 16°18′42.71″E48°11′04.26″N, 16°18′42.71″E Informazioni generaliCondizioniIn uso Costruzione1696 - 1780 Stilebarocco e barocco RealizzazioneArchitettoJohann Bernhard Fischer von ErlachNicolò Pacassi ProprietarioLeopoldo I d'Asburgo CommittenteLeopoldo I Modifica dati su Wikidata · Manual...

 

2008 Montana Democratic presidential primary

2008 Montana Democratic presidential primary ← 2004 June 3, 2008 (2008-06-03) 2016 → ← PRSD →   Candidate Barack Obama Hillary Clinton Party Democratic Democratic Home state Illinois New York Popular vote 103,174 74,889 Percentage 56.56% 41.05% Primary results by county Clinton:      40–50%      50–60%Obama:      50–60%    &...

 

Carlo Schmid

Der Titel dieses Artikels ist mehrdeutig. Weitere Bedeutungen sind unter Carlo Schmid (Begriffsklärung) aufgeführt. Carlo Schmid (1963) Signatur Carlo Schmid, 1967 Carlo Schmid (* 3. Dezember 1896 in Perpignan, Frankreich, als Charles Jean Martin Henri[1] sowie als Karl Johann Martin Heinrich Schmid[2]; † 11. Dezember 1979 in Bad Honnef) war ein deutscher Politiker (SPD) und renommierter Staatsrechtler. Schmid gehört zu den Vätern des Grundgesetzes u...

Juan d'Arienzo

Argentine musician Juan d'ArienzoBackground informationBorn(1900-12-14)December 14, 1900DiedJanuary 14, 1976(1976-01-14) (aged 75)GenresTango, MilongaInstrument(s)Bandoneon, Violin, PianoMusical artist Juan d'Arienzo (December 14, 1900 – January 14, 1976) was an Argentine tango musician, also known as El Rey del Compás (King of the Beat). He was a violinist, band leader, and composer. He was the son of Italian immigrants and used more modern arrangements and instrumentation; his popul...

 

Castello Spinola-Mignacco

Castello Spinola-MignaccoLocalizzazioneStato Italia RegioneLiguria LocalitàIsola del Cantone IndirizzoVia Piano, 1, Isola del Cantone (GE) Coordinate44°38′40.26″N 8°57′35.14″E44°38′40.26″N, 8°57′35.14″E Informazioni generaliCondizioniIn uso CostruzioneXVI secolo Usocivile RealizzazioneCommittenteSpinola Modifica dati su Wikidata · Manuale Il castello Spinola-Mignacco o castello di Piano è un palazzo risalente al XVI secolo che fu dimora della famiglia Spinola ...