Согласно опубликованному 25 сентября 2020 года на информационном интернет-ресурсе «Бюллетень кинопрокатчика» рейтингу профессионалов киноиндустрии, которые проанализировали достижения главных российских актрис в 2010 – 2019 годах, вошла в «Топ-10 главных киноактрис России», заняв в нём 9-е место[3].
О периоде взросления и изменении мировоззрения своей старшей дочери от шести до восемнадцати лет Никита Сергеевич в 1993 году снял документальный фильм-эксперимент «Анна: от 6 до 18», в котором в течение предшествующих двенадцати лет задавал ей одни и те же вопросы и получал ответы, которые монтировал с исторической документальной видеохроникой событий, происходивших в советской и постсоветской России в те годы, когда задавались вопросы[5].
С марта 2002 года ведёт вечернюю телевизионную программу для детей дошкольного и младшего школьного возраста «Спокойной ночи, малыши!» на телеканалах «Культура» («Россия-Культура») и «РТР» («Россия», «Россия-1»)[6][8]. 18 июня 2019 года за работу в этой телепередаче на канале-вещателе «Россия-Культура» Анна Михалкова стала лауреатом российской национальной телевизионной премии за лучшие телепрограммы для детей «ТЭФИ-KIDS» в номинации «Ведущий телевизионной программы для детей» за 2019 год[10][11].
В 2003 году стала одним из создателей и продюсером кинооператорской премии «Белый квадрат», которая вручается ежегодно Гильдией кинооператоров России за лучшую операторскую работу в полнометражных художественных фильмах[12].
«Ощущение комфорта, уверенности в себе пришло гораздо позже, чем я окончила институт. Произошло это после фильма „Свои“. Я поняла, как наилучшим образом использовать свои навыки, внутренние и внешние данные. Существовала свободная, никем не занятая ниша, которую я попыталась занять.»
Большое количество наград актрисе принесло сотворчество с режиссёром Авдотьей Смирновой. Первая их совместная работа — драма «Связь» (2006), фильм о любви замужней женщины Нины (в исполнении Анны Михалковой) и женатого мужчины, которые так и не решились соединить свои судьбы. За эту роль 27 января 2007 года актриса получила кинопремию «Золотой орёл» в номинации «Лучшая женская роль в кино» за 2006 год[15]. Затем последовал трагикомедийный художественный фильм «Кококо» (2012), сценарий которого был написан Анной Пармас специально под Анну Михалкову[8]. 10 июня 2012 года за исполнение роли Елизаветы Воронцовой в этой картине актриса получила приз «За лучшую женскую роль» на XXIII Открытом российском кинофестивале «Кинотавр» в Сочи[16], а 25 ноября 2012 года — приз «За лучшую женскую роль» (совместно с Яной Трояновой) на ХХ Фестивале российского кино в Онфлёре (Франция)[17].
В апреле 2015 года дебютировала в театральной постановке — сыграла главную роль мамы в спектакле «Как выдать маму замуж» по одноимённой пьесе братьев Олега и Владимира Пресняковых (режиссёр — Павел Сафонов) в бывшем клубе «Артист» в Москве[4].
В 2017 году актриса исполнила одну из главных ролей в медицинском детективном телесериале «Доктор Рихтер» режиссёра Андрея Прошкина, официальной адаптации американского сериала «Доктор Хаус». Елизавета Никольская, главный врач и главная сдерживающая сила доктора Рихтера, получилась совсем не похожей на персонажа из американского сериала. Андрей Прошкин прокомментировал выбор её кандидатуры:
«У меня сначала было удивление, а потом, наоборот, мы как-то загорелись этой идеей. Именно её непохожесть показалась интересной. И сразу было ощущение, что у них получится хороший тандем с Серебряковым, как, на мой взгляд, и вышло. А Михалкову я готов снимать в любой роли, потому что я большой её поклонник.»
Анна Михалкова активно снимается в кино и параллельно с этим пробует себя в качестве кинопродюсера. Первым её самостоятельным проектом стал социальный триллер Леонида Рыбакова «Скажи Лео» (2008) о реальном и виртуальном мире. В 2009 году с режиссёром Игорем Волошиным Михалкова выпустила драму «Я». Позже вышла мелодрама Алисы Хмельницкой и Резо Гигинеишвили «Без мужчин» (2010), где одну из главных ролей исполнила её сестра Надежда. В 2014 году выпустила детский комедийный фильм «Федька» в сотворчестве с Любовью Андреевой.
«Я очень люблю сниматься, но этим мои интересы в кино не ограничиваются. У меня всегда были хорошие организаторские способности, хотелось найти им применение, например, помогать друзьям в осуществлении их творческих замыслов. Меня увлекают оригинальные идеи, я хочу быть причастной к их воплощению. Это завораживающий для меня процесс.»
Муж — Альберт Владимирович Баков (род. 27 мая 1962), предприниматель, экс-генеральный директор АО «ЦНИИточмаш» (2018—2021)[18][19]. Михалкова и Баков познакомились в 1997 году на одной из вечеринок «Российского фонда культуры» и вскоре поженились[8]. В 2006 году супруги развелись, а через год снова поженились[20].
У супругов трое детей: сыновья Андрей (род. 2000) и Сергей (род. 2001)[8], дочь Лидия (род. 9 сентября 2013)[8][20].
2015 — спектакль «Как выдать маму замуж» по одноимённой пьесе братьев Олега и Владимира Пресняковых (режиссёр — Павел Сафонов; премьера прошла в апреле 2015 года в бывшем клубе «Артист» в Москве) — мама (театральный дебют актрисы)[4]
2012 — приз «За лучшую женскую роль» (совместно с Яной Трояновой) за 2012 год на XXIII Открытом российском кинофестивале «Кинотавр» в Сочи (10 июня 2012 года) — за исполнение роли Елизаветы Воронцовой в трагикомедийном художественном фильме «Кококо» (2012) режиссёра Авдотьи Смирновой[16].
2012 — приз «За лучшую женскую роль» (совместно с Яной Трояновой) на ХХ Фестивале российского кино в Онфлёре (Франция) (25 ноября 2012 года) — за исполнение роли Елизаветы Воронцовой в трагикомедийном художественном фильме «Кококо» (2012) режиссёра Авдотьи Смирновой[17].
2013 — номинация на кинопремию «Ника» в категории «Лучшая женская роль» за 2012 год (2 апреля 2013 года) — за исполнение роли Елизаветы Воронцовой в трагикомедийном художественном фильме «Кококо» (2012) режиссёра Авдотьи Смирновой.
2019 — лауреат российской национальной телевизионной премии за лучшие телепрограммы для детей «ТЭФИ-KIDS» в номинации «Ведущий телевизорной программы для детей» за 2019 год (18 июня 2019 года) — за ведение вечерней телевизионной программы для детей дошкольного и младшего школьного возраста «Спокойной ночи, малыши!» на канале-вещателе «Россия-Культура» (Москва)[10][11].
2019 — лауреат российской национальной телевизионной премии «ТЭФИ» в категории «Вечерний прайм» в номинации «Лучшая актриса телевизионного фильма/сериала» за 2019 год (2 октября 2019 года) — за исполнение главной роли Марины Лавровой в детективном телесериале «Обычная женщина» (2018) режиссёров Бориса Хлебникова и Наталии Мещаниновой[31][32].
2019 — специальный диплом жюри «за талантливое исполнение главной женской роли» на ХХ Всероссийском фестивале кинокомедий «Улыбнись, Россия!» в Туле (2—8 ноября 2019 года) — за исполнение главной роли Маши Елисеевой в комедийном художественном фильме «Давай разведёмся!» режиссёра Анны Пармас[33][34][35].