«Минск-2006» был создан в 2006 году[2]. В сезоне 2006/2007 команда начала выступать в чемпионате Беларуси. Объединивший в своей структуре сразу четыре подразделения (мужскую и женскую команды, дублёров и детско-юношескую школу), клуб в первом же сезоне добрался до полуфинала плей-офф, где уступил «Виталюру», впоследствии ставшим чемпионом.
Сезон 2007/2008 «Минск» вновь завершил в полуфинале, уступив дорогу в финал осиповичскому ОЗАА. В матче за третье место клуб проиграл «Гродно-93». В этом сезоне были кардинальные перемены в составе. На паркет белорусского чемпионата вышли американские легионеры: Данте Стиггерс и Томас Блант.
В пятом туре чемпионата 2008/2009 на чужой площадке «Минск-2006» одержал две победы над принципиальным соперником — «Виталюром». Реванш «Виталюр» взял в Кубке Беларуси. Одолев могилевский «Темп-ОШВСМ», осиповичский ОЗАА и «Виталюр», подопечные дебютировавшего на тренерском мостике Андрея Кривоноса впервые стали чемпионами Беларуси.
В сезоне 2009/2010, начиная первым матчем регулярного турнира и заканчивая финалом плей-офф, «Минск-2006» ни разу не потерпел поражения и завоевал второй чемпионский титул. В этот год был взят и Кубок Беларуси. В сезоне 2009/2010 «Минск-2006» заявился в турнир «Eurochallenge», став первым за долгие годы белорусским клубом, который стал участником еврокубков. Стартовав с поражения от самарских «Красных крыльев», «Минск-2006» реабилитировался с «Амстердамом» и финишировал в группе на третьем месте, пропустив в плей-офф россиян и итальянский «Скаволини».
В сезоне 2010/2011 «МИНСК» снова стал чемпионом Беларуси. В этом сезоне клуб также начал выступать в Единой Лиге ВТБ.
14 сентября 2012 года клуб был переименован в «Цмокі-Мінск». По белорусской мифологии, цмоком называли домового змея, ужа, который приносил своему хозяину деньги, делал его нивы плодородными, а коров — дойными.
В июне 2024 года было объявлено об уходе команды из Единой лиги ВТБ по инициативе руководства клуба.[3]
По итогам данного группового этапа клуб с двумя победами занял третье место в группе C и не прошёл дальше.
Сезон 2010/2011
Клуб не прошёл квалификационный раунд Кубка вызова ФИБА 2010/11, проиграв по сумме двух встреч бельгийскому «Антверпену» (ничья 87:87 в домашней игре и проигрыш 80:89 в гостевой, по сумме двух встреч 167:176).
Сезон 2019/2020
Клуб квалифицировался в первом раунде Лиги чемпионов ФИБА на клуб «Каухайоен Карху» (Финляндия).
Молодёжная команда баскетбольного клуба «Минск» создана в 2006 году. С 2011 года команда выступает в Высшей лиге чемпионата Беларуси, становилась бронзовым призёром в сезонах 2011/2012 и 2013/2014. Команда выступает в Европейской юношеской баскетбольной лиге (ЕЮБЛ) для игроков не старше 20 лет, стала победителем этого турнира в сезоне 2014/2015[4]. В сезоне 2024/2025 команда дебютировала в Единой молодёжной лиге ВТБ[5].
Молодёжная команда БК «Минск» является базовой для молодёжной сборной Беларуси (U-20).
Резервная команда
Резервная команда баскетбольного клуба «Минск» создана в 2017 году. В команде выступают белорусские баскетболисты, являющиеся кандидатами в мужскую сборную Беларуси.
В сезоне 2017/2018 резервная команда считалась частью основной, заменяла её в чемпионате и Кубке Беларуси (выиграла оба турнира), выступала в Балтийской лиге. Начиная с сезона 2018/2019 резерв выступал в чемпионате Беларуси отдельно от основной команды, а также участвовал (вне конкурса) во втором дивизионе чемпионата Литвы — Национальной баскетбольной лиге[6]. В сезоне 2018/2019 команда завоевала бронзовые медали чемпионата Беларуси[7]. В сезоне 2020/2021 резервная команда была частью основной, заменяла её в большинстве матчей чемпионата Беларуси, когда основа была занята в Единой лиге ВТБ и Лиге чемпионов ФИБА. С сезона 2021/2022 резерв снова выступал в чемпионате Беларуси в качестве самостоятельной команды, а также участвовал в Студенческой лиге РЖД. Перед сезоном 2024/2025 резерв объединился с основной командой.
СДЮШОР БК «Минск»
Специализированная детско-юношеская школа олимпийского резерва баскетбольного клуба «Минск» создана в 2006 году на базе СДЮШОР № 10 города Минска, основанной в 1972 году[8]. В школе обучается около тысячи воспитанников. Команды СДЮШОР разных возрастов принимают участие в Европейской юношеской баскетбольной лиге, Балтийской лиге, Детско-юношеской лиге, а также в различных международных турнирах.
В чемпионате Беларуси школу с 2017 года представляет команда РЦОП-СДЮШОР, являвшаяся базовой для юниорской сборной Беларуси (U-18) (до 2020 года) и юношеской сборной Беларуси (U-16) (с 2020 года).