По возвращении на Балканы в 1889 году стал преподавателем Призренской духовной семинарии. Был в этом заведении первым ректором духовного звания и с высшим духовным образованием. Завёл порядок в общежитии семинарии и в учебной части, а мирным и тихим характером снискал себе любовь в народе.
Он был отправлен на пенсию 15 июня 1913 года, так и не сумев улучшить тяжёлое материальное положение подчинённого ему священства, несмотря на ряд принятых им административных мер и усилий. Оставшуюся жизнь провел в монастыре Хиландар на Афоне, где и скончался 7 ноября 1921 года.
Литература
Сава Српски јераси од деветог до двадесетог века, С. 312;
Споменица Тимочке епархије 1834—1934. Сремски Карловци, 1934. С. 15-18;
Преосвећени Мелентије, бивши епископ тимочки (некролог) // Гласник — службени лист Српске православне патријаршије. Бр. 22. 1921. С. 361—364.
Игнатије Марковић. Епископ тимочки Мелентије Вујић — поводом 90 година од упокојења // Календар Црква за 2011 годину. С. 140—143)