Марк Юний принадлежал к плебейскому роду Юниев, первые достоверные известия о котором относятся к концу IV века до н. э. Согласно Капитолийским фастам, у отца и деда Марка Юния был преноменДецим[1]; таким образом, он был сыном Децима Юния Перы, консула 266 года до н. э.[2] У его деда было два когномена — Пера (Pera) и Брут (Brutus)[3]. В историографии считается, что Юнии Перы — одно из трёх ответвлений от основной линии рода, Юниев Брутов[4].
Первое упоминание Марка Юния в источниках относится к 230 году до н. э., когда он стал консулом вместе с патрициемМарком Эмилием Барбулой[5][2]. В этой должности Пера воевал с лигурами[6]. Вместе с патрициемГаем Клавдием Центоном он стал цензором в 225 году до н. э.[7]. Именно эти цензоры провели перепись всех военнообязанных Италии, упомянутую Полибием, причём насчитали 700 тысяч пехоты и 70 тысяч конницы[8].
Летом 216 года до н. э., получив известия о разгроме римской армии при Каннах, сенат назначил Марка Юния диктатором[9]. Тот сделал своим начальником конницыэдилиция (бывшего эдила) Тиберия Семпрония Гракха и занялся пополнением армии: сформировал четыре легиона из молодёжи, выкупил у хозяев 8 тысяч рабов, отправил в войско 6 тысяч преступников из тюрем, потребовал воинов от союзников[10][11]. Нехватка оружия была отчасти покрыта трофеями из храмов. Предложение Ганнибала начать переговоры Марк Юний отверг: карфагенскому посланцу Карталону было предписано через ликтора покинуть принадлежащие Риму земли[12].
Осенью Марк Юний двинулся с 25-тысячным войском в Кампанию, к городу Казилин, но вскоре был вынужден вернуться в Рим, чтобы совершить повторные ауспиции; командующим вместо себя он оставил Гракха[13]. К этому же периоду относятся сообщения источников о военной хитрости, применённой Ганнибалом против Юния: карфагеняне вынудили римлян простоять всю ночь на лагерном валу под дождём, а утром напали и захватили лагерь[14][15].
В конце года Марк Юний по вызову сената отправился в Рим и провёл консульские выборы, причём одним из победителей голосования стал его начальник конницы — Тиберий Семпроний. После этого он вернулся в зимний лагерь в Теане. Позже его войско было передано консулу[16]. В историографии существует мнение, что недовольство сенаторов низкой эффективностью Перы как военачальника стало причиной отказа от избрания диктаторов для командования войсками[15].