Начиная с XIX века, лингвисты предлагали различные гипотезы об объединении индейских языков в макросемьи. Часть гипотез из приведенного ниже списка была в дальнейшем отвергнута.

1. Ахуаке-калианские языки ← en:Ahuaque-Kalianan
2. Алгонкинско-заливные языки ← en:Algonkian-Gulf   (= Algic + Beothuk + Gulf)
3. Алгонкинско-вакашанские языки ← en:Algonquian-Wakashan   (also known as Almosan)
4. Языки алмос-кересиу ← en:Almosan-Keresiouan (= Almosan + Keresiouan)
5. Америндские языки ← Amerind   (= все языки коренного населения Северной и Южной Америки, за исключением эскимосско-алеутских и на-дене)
6. Аравакские языки или макро-аравакские языки ← en:Arawakan
7. Ацтекско-таноанские языки ← en:Aztec-Tanoan   (= Uto-Aztecan + Kiowa-Tanoan)
8. Чибчанские языки ← en:Chibchan stock
9. Языки чибча-паэса ← en:Chibchan-Paezan
10. Языки чикитано-боророа ← en:Chikitano-Boróroan
11. Коахуильтеканские языки ← en:Coahuiltecan   (= Coahuilteco + Cotoname + Comecrudan + Karankawa + Tonkawa)
12. Кунса-капиханские языки ← en:Cunza-Kapixanan
13. Дене-енисейские языки ← Dené-Yeniseian
14. Дене-кавказские языки ← Dené-Caucasian
15. Языки эсмеральда-яруроа ← en:Esmeralda-Yaruroan
16. Гуамо-чапакурские языки ← en:Guamo-Chapacuran
17. Языки залива ← Gulf   (= Muskogean + Natchez + Tunica)
18. Хокские языки   (= Karok + Chimariko + Shastan + Palaihnihan + Yana + Pomoan + Washo + Esselen + Yuman-Cochimí + Salinan + Chumashan + Seri + Tequistlatecan)
19. Языки хок-сиу ← en:Hokan-Siouan   (= Hokan + Subtiaba-Tlappanec + Coahuiltecan + Yukian + Keresan + Tunican + Iroquoian + Caddoan + Siouan-Catawba + Yuchi + Natchez + Muskogean + Timucua)
20. Языки хавароа-кахуапан ← en:Javaroan-Cahuapanan
21. Же-тупи-карибские языки ← en:Je-Tupi-Carib
22. Калианские языки ← en:Kalianan
23. Кавескарский языковой союз ← en:Kaweskar language area
24. Языки кересиу ← en:Keresiouan   (= Keres + Siouan + Iroquoian + Caddoan + Yuchi)
25. Луле-вилельские языки ← en:Lule-Vilelan
26. Макро-андские языки ← en:Macro-Andean
27. Макро-аравакские языки ← en:Macro-Arawakan
28. Макро-карибские языки ← en:Macro-Carib
29. Языки макро-же ← en:Macro-Gê (also known as Macro-Jê)
30. Языки макро-катембри-таруна ← en:Macro-Katembrí-Taruma
31. ← en:Macro-Kulyi-Cholónan
32. ← en:Macro-Lekoan
33. ← en:Macro-Mayan
34. ← en:Macro-Otomákoan
35. ← en:Macro-Paesan
36. ← en:Macro-Panoan
37. ← en:Macro-Puinávean
38. ← Macro-Siouan   (= Siouan + Iroquoian + Caddoan)
39. ← en:Macro-Tekiraka-Kanichana
40. ← en:Macro-Tucanoan
41. ← en:Macro-Tupí-Karibe
42. ← en:Macro-Waikurúan
43. ← en:Macro-Warpean
44. ← en:Mosan   (= Salishan + Wakashan + Chimakuan)
45. ← en:Mosetén-Chonan
46. ← en:Mura-Matanawian
47. Языки на-дене, в том числе хайда   (= Haida + Tlingit + Eyak + Athabaskan)
48. Ностратико-америндские языки ← en:Nostratic-Amerind
49. ← en:Paezan (= Andaqui + Paez + Panzaleo)
50. ← en:Paezan-Barbacoan
51. Пенутийские языки   (= many languages of California and sometimes languages in Mexico)
    1. Калифорнийские пенутийские языки   (= Wintuan + Maiduan + Yokutsan + Utian)
    2. Орегонские пенутийские языки   (= Takelma + Coosan + Siuslaw + Alsean)
    3. Мексиканские пенутийские языки   (= Mixe-Zoque + Huave)
52. Кечумарские языки ← en:Quechumaran
53. Такелма-калапуянские языки   (= Takelma + Kalapuyan)
54. Туникские языки ← en:Tunican   (= Tunica + Atakapa + Chitimacha)
55. Йок-утийские языки ← en:Yok-Utian
56. Юри-тикунские языки ← en:Yuri-Ticunan
57. Языки сапароа-ягу ← en:Zaparoan-Yaguan

Довольно подробный анализ данных гипотез приводят Кэмпбелл (Campbell, 1997), Кэмпбелл и Митхун (Campbell & Mithun, 1979).

• Индейские языки Северной Америки
• Индейские языки Южной Америки

• Bright, William. (1984). The classification of North American and Meso-American Indian languages. In W. Bright (Ed.), American Indian linguistics and literature (pp. 3–29). Berlin: Mouton de Gruyter.
• Bright, William (Ed.). (1984). American Indian linguistics and literature. Berlin: Mouton de Gruyter. ISBN 3-11-009846-6.
• Brinton, Daniel G. (1891). The American race. New York: D. C. Hodges.
• Campbell, Lyle. (1997). American Indian languages: The historical linguistics of Native America. New York: Oxford University Press. ISBN 0-19-509427-1.
• Campbell, Lyle; & Mithun, Marianne (Eds.). (1979). The languages of native America: Historical and comparative assessment. Austin: University of Texas Press.
• Gordon, Raymond G., Jr. (Ed.). (2005). Ethnologue: Languages of the world (15th ed.). Dallas, TX: SIL International. ISBN 1-55671-159-X. (Online version: http://www.ethnologue.com).

• Archivo de Lenguas Indígenas de México (El Colegio de México)
• South American Languages
• How many indigenous American languages are spoken in the United States? By how many speakers?
• Virtual museum of the indigineous languages of Mexico
• Promotora Española de Lingüística (Proel)
• Documentation Center of the Linguistic Minorities of Panama
  • Linguistic map (DCLMP)
• The Archive of the Indigenous Languages of Latin America
• First People’s Language Resources (Online, Offline, Commercial & Non-Commercial)
• Indigenous Language Institute
• The Society for the Study of the Indigenous Languages of the Americas (SSILA)
• The Yinka Déné Language Institute (YDLI)
• The First Nations Languages of British Columbia (YDLI)
  • Index of Variant Language Names (in British Columbia) (YDLI)
• Southern Oregon Digital Archives First Nations Tribal Collection (beautiful collection of ethnographic, linguistic, & historical material)
• Handbook of the North American Indians
• Center for the Study of the Native Languages of the Plains and Southwest
• Project for the Documentation of the Languages of Mesoamerica Архивная копия от 18 марта 2012 на Wayback Machine
• Programa de Formación en Educación Intercultural Bilingüe para los Países Andinos
• Yukon Native Language Centre
• Bibliographies of Northern and Central California Indians
• Native American Language Center (University of California at Davis)
• Map of languages in the US — William C. Sturtevant. (1967). Early Indian tribes, culture areas, and linguistic stocks.:
  • Alaska & Hawai‘i
  • Western US
  • Eastern US
• Native Languages of the Americas
• International Journal of American Linguistics (one of the best scholarly journals devoted mostly to Native American linguistics)
• Our Languages (Saskatchewan Indian Cultural Centre)
• Etnolinguistica.Org: a discussion list on native South American languages
• Potawatomi Language Project Kansas Humanities Council
• Swadesh Lists of Brazilian Native Languages