В 1938 году был направлен на работу в Управление НКВД по Ленинградской области, а затем переведён в Москву для прохождения службы в центральном аппарате НКВД. С июля 1939 года по июнь 1941 года находился в служебной командировке в США.
Возвратившись в Москву, Лягин с группой сотрудников разведки направляется в город Николаев для организации разведывательно-диверсионной работы против немецких оккупантов, возглавляет там деятельность подпольной антифашистской группы «Николаевский подпольный центр». Группа Лягина осуществила ряд крупных диверсий, причинивших немецким оккупантам большой ущерб в живой силе и технике (уничтожила аэродром, нефтебазу, склады, оборудование заводов, морские суда), добывала и передавала в Центр ценную разведывательную информацию о противнике.
В марте 1943 года был схвачен при выполнении задания. На допросах под пытками не выдал участников группы. 17 июля 1943 года Лягин был расстрелян.
За образцовое выполнение специальных заданий в тылу противника и проявленные при этом отвагу и геройство Виктору Александровичу Лягину 5 ноября1944 года посмертно присвоено звание Героя Советского Союза.
В городе Сельцо имя В. А. Лягина носит бывшая Вокзальная улица, на которой родился и жил будущий Герой, а также его имя носит Сельцовская средняя школа № 1.
В городе Санкт-Петербурге на доме № 7 по улице Пестеля, где жил Лягин, а также на доме № 15 в Красногвардейском переулке, где он работал, открыты мемориальные доски. На Большеохтинском кладбище, при захоронении жены и дочери, устроена надпись-кенотаф Герою Советского Союза В. А. Лягину. Сквер на углу Политехнической улицы и улицы Хлопина назван в его честь.[1]
Бондаренко А. Ю. Виктор Лягин. Подвиг разведчика. — М.: Молодая гвардия, 2017. — 359 с. — (Жизнь замечательных людей: серия биографий: выпуск 1648). — ISBN 978-5-235-03999-5.
