Луи начал карьеру в местном клубе «Миребалаис». В 2010 году полузащитника заметили скауты французского «Ле-Мана» и пригласили в команду. Джефф начал выступления за команду дублёров. 24 сентября в матче против «Дижона» он дебютировал в Лиге 2[1]. 16 мая 2011 года в поединке против «Лаваля» Луи забил свой первый гол за команду[2]. В следующем сезоне Джефф выиграл конкуренцию за место в основе и стал одним из ключевых футболистов клуба.
В 2012 году Луи перешёл в «Нанси». 17 августа в матче против «Лилля» он дебютировал в Лиге 1[3]. Из-за высокой конкуренции Джефф чередовал выступления за основную команду и дубль, как и в «Ле-Мане», во втором сезоне он стал одним из лидеров команды. 18 октября в поединке против «Клермона» Луи забил свои первые голы за «Нанси»[4]. 3 февраля 2014 года в матче против «Гавра» Джефф сделал первый в карьере хет-трик[5].
В мае того же года предметный интерес к Луи проявлял шотландский «Селтик», но в итоге Джефф перешёл в льежский «Стандард». Сумма трансфера составила 1,9 млн. евро. 15 августа в матче против «Мускрон-Перювельз» он дебютировал в Жюпиле лиге[6]. 23 августа в поединке против «Вестерло» Луи забил свой первый гол за клуб из Льежа[7].
Летом 2015 года Джефф перешёл в «Кан». 22 августа в матче против «Ниццы» он дебютировал за новую команду[8]. 19 сентября в поединке против «Монпелье» Луи забил свой первый гол за «Кан»[9].