Некоторое время пожив в деревне людей, Маугли становится местной знаменитостью благодаря своим рассказам о веселье в джунглях. Однако его приёмный отец, которого Маугли называет «сэр», боится джунглей из-за царапины, полученной от Шер-Хана. Маугли скучает по джунглям, то же самое чувствует по отношению к нему его старый друг Медведь Балу. Однажды он, даже несмотря на запрет Багиры, пробирается в деревню и забирает Маугли, к великой радости последнего. За ними по пятам идут возлюбленная Маугли, девочка Шанти, и его маленький сводный брат Ранджан, который втайне очарован его рассказами о джунглях и хочет жить вольной жизнью диких зверей. Но не только эти четверо вышли на арену: тигр Шер-Хан жаждет мальчику мести и теперь намерен убить его…
Идея создать сиквел к мультфильму «Книга джунглей» появилась в 1990-е года. Оригинальная идея имела следующий сюжет: Балу влюбляется в медведицу и пытается спасти её от браконьера. Однако в конечном счёте студия Дисней решила создать другую версию сиквела, с оригинальными персонажами[8][9].
Джон Гудмен записывал своё озвучивание в Новом Орлеане, в то время, как Хэйли Джоэл Осмент записывал озвучивание в Калифорнии[5].
В 2001 году возник конфликт по-поводу персонажа Луи. Вдова Луи Прима, озвучившего джазовое пение обезьяньего короля Луи в мультфильме «Книга джунглей» 1967 года, подала иск против Диснея за «нарушение договора без выплаты авторских отчислений, обогащение, мошенничество и неумышленное введение в заблуждение». По её мнению, Дисней незаконно использовал персонажа Луи, а также голос её мужа в своих других работах. Позднее конфликт был урегулирован Диснеем во внесудебном порядке, пообещав больше нигде не использовать образ Луи. Это основная причина, почему он не появляется в сиквеле[5].
Во время исполнения классической мелодии «Ищи лишь только нужное» из первой части мультфильма, два грушевидных предмета ударяют удава Каа по голове, делая его похожим в этот момент на Микки Мауса[5].