Родился в 1611 году в семье Альбрехта Каплиржа (ум. 1614) и приходился внуком чешского государственному деятелюКашпару Каплиржу (1535—1621), который первое время воспитывал мальчика после смерти его отца. Когда Кашпар Каплирж был казнён за участие в антигабсбургском восстании 1618 года, а его имущество было конфисковано, для семьи настали тяжёлые времена. Мать Зденека, которому было не более восьми лет, и который к этому времени потерял, как отца, так и деда, была вынуждена переехать жить к родственникам.
Достигнув подходящего возраста, Зденек Каплирж поступил на службу в имперскую армию. В 1632 году он унаследовал поместье от двоюродного брата. К 1649 году стал полковником и полковым командиром. Отличился в боях против французов в Ломбардии на стороне испанцев (1649).
Во время осады Вены турками в 1683 году Каплирж был назначен руководить гражданским управлением столицы во время отсутствия императора. Каплирж отвечал за распределение продовольствия, вербовку новых солдат из числа горожан, и занимался прочими вопросами, связанными с регулированием повседневной жизни осаждённого города. Когда же был ранен военный губернатор фельдмаршал граф Штаремберг, то Каплирж временно принял на себя и руководство обороной, причём проявил себя, в частности, установкой новых батарей.
В декабре 1683 года император произвёл Каплиржа в фельдмаршалы, а благодарные жители Вены поднесли ему 1 500 гульденов. Однако, силы Каплиржа были подорваны долгой и утомительной работой в условиях осады, и после того, как турки были разбиты, он слёг в постель и в торжествах не участвовал.
Фельдмаршал был женат несколько раз, но потомства не оставил.
В 1686 году Каплирж скончался в Вене и был похоронен в построенной им часовне Святого Антония в Милешау. Каплирж завещал, чтобы ежегодно, 12 сентября (день снятия осады Вены) в Милешау должна проводилась праздничная месса, после которой местным беднякам должна раздаваться милостыня на общую сумму 62 гульдена (большая сумма денег по тем временам). Завещание Каплиржа продолжало соблюдаться даже в XIX веке, хотя прямых наследников он не имел и его графский титул не был передан кому-либо.
Литература
Freiherr von Helfert, Caspar Zdenko Graf von Capliers in Berichte und Mittheilungen des Alterthums-vereines zu Wien, Jg. 1881, S. 120ff
Oscar Criste: Capliers, Caspar Zdenko Graf. In: Allgemeine Deutsche Biographie (ADB). Band 47, Duncker & Humblot, Leipzig 1903, S. 442–445.