Гаплогруппа K(xLT) (Y-ДНК)

Гаплогруппа K(xLT) - MNOPS
Происхождение гаплогруппы K(xLT) - MNOPSПроисхождение гаплогруппы K(xLT) - MNOPS
Тип макрогруппа Y-ДНК
Время появления 55–47 тыс.л.н.
Место появления южная или центральная Азия
Предковая группа макрогруппа K
Сестринские группы макрогруппа LT (предок L и T)
Субклады K1, K2, K3, M и S, макрогруппы NO и P
Мутации-маркеры M526/PF5979 (изначально rs2033003)

В популяционной генетике и геногеографии человека, изучающих Y-хромосомные гаплогруппы, K2 или K-M526 (ранее известная как K(xLT) и MNOPS) — патрилинейная наследственность, характеризуемая Y-хромосомной ДНК-мутацией M526/PF5979[1]. Поскольку от неё происходит целый ряд других гаплогрупп, является макрогруппой. По данным компании YFull гаплогруппа K2 произошла от макрогруппы K-M9 47200 лет назад[2]. Тамара Карафет с коллегами в работе 2014 года пришла к выводу, что быстрая диверсификация K2-M526 произошла, вероятно, в Юго-Восточной Азии[3].

В ранних версиях древа Y-ДНК отсутствовала (в макрогруппе K, наряду с малыми субкладами, напрямую выделялись ветви L, M, NO и P, в 2008 году к ним добавились S и T). Впоследствии в группах NO и P была открыта общая мутация rs2033003, и в 2009 году эти гаплогруппы стали рассматриваться как ветви макрогруппы NOP. Однако уже в 2010 году выяснилось, что эта же метка (получившая имя M526) присутствует и в группах M и S, так что была сформирована макрогруппа MNOPS. Далее, в 2011 году были обнаружены мутации, роднящие гаплогруппы L и T, а M526 была обнаружена и у малых субклад K1, K2, K3 и K4, так что на дереве гаплогрупп появилась группа LT, а группу MNOPS переименовали в K(xLT), поскольку теперь под макрогруппой K осталось лишь две ветви: «LT» и «не-LT».

Это «революционное» решение ИХК (англ. Y Chromosome Consortium (YCC)) породило ряд споров, потому что, во-первых, возникла путаница: группы K1, K2, K3, K4 стали относиться не напрямую к K, но вместо этого к её субкладе K(xLT), во-вторых, формулировка вида «K(xLT)» традиционно означала «всё, относящееся к K, кроме относящегося к LT» (или, короче — «K вне LT»), и теперь нет очевидного способа различать между старым и новым употреблением. Разница в их значениях в данном конкретном случае не велика, но вполне определённа, а именно: «K(xLT)» в традиционном смысле включало бы также парагруппу K* и возможно открытые бы в будущем ветви K, не имеющие метки M526, но не относящиеся и к LT.

Традиционным решением в такой ситуации могло бы быть:

  1. переименовать гаплогруппы K1, K2, K3 и K4 в U, V, W и X, а макрогруппу MNOPS в MNOPSUVWX;
  2. переименовать K1, K2, K3 и K4 в K(xLT)1, K(xLT)2, K(xLT)3 и K(xLT)4;
  3. переименовать LT в K1, MNOPS в K2, а K1, K2, K3 и K4 в K2a, K2b, K2c и K2d, в этом случае M, NO, P и S оказываются подмножествами ветви K2;

однако Консорциум не счёл эти варианты удовлетворительными и постановил в порядке исключения допустить иерархическую несогласованность в обозначении ветвей K и K(xLT).

В 2012 году подветвь K1 была язъята из дерева, так как была признана недостаточно древней, а K2, K3 и K4 переименованы в K1, K2 и K3 соответственно.

Палеогеография

Древо

Общая структура следующая:

Древо именованных субклад макрогруппы K(xLT) и определяющие их мутации на начало 2013 года выглядят следующим образом[10] (нисходящие ветви гаплогрупп опущены):

K(xLT) (M526/PF5979)

  • K(xLT)* -
  • K1 (P60, P304, P308)
  • K2 (P79, P299, P307)
  • K3 (P261, P263)
  • M (P256, Page93)
  • NO (M214/Page39, P188, P192, P193, P194, P195)
    • NO* -
    • N (M231/Page91, Page56/S323)
    • O (M175, P186, P191, P196)
  • P (92R7_1, 92R7_2, L138, L268, L405, L471/PF5989, L536/PF5860, L721/PF6020, L741, L768/PF5976/YSC0000274, L779/PF5907/YSC0000251, L781/PF5875/YSC0000255, M45/PF5962, M74/N12, P27.1_1/P207, P27.1_2, P69, P226/PF5879, P228/PF5927, P230/PF5925, P235/PF5946, P237/PF5873, P239, P240/PF5897, P243/PF5874, P244, P281/PF5941, P282/PF5932, P283/PF5966, P284, P295/PF5866/S8, Page83)
    • Q (M242)
    • R (M207/Page37/UTY2, P224, P227, P229, P232, P280, P285, S4, S9)
  • S (M230,P202, P204)


Эволюционное древо гаплогрупп Y-хромосомы человека
Y-хромосомный Адам
A00 A0T
A0 A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F* GHIJK
G HIJK
H IJK
IJ K
I J K1 K2
L  T       NO K2b
N O   K2b1     P  
S M Q R  


Примечания

  1. ↑ Jacques Chiaroni, Peter A. Underhill, and Luca L. Cavalli-Sforza, "Y chromosome diversity, human expansion, drift, and cultural evolution, " PNAS published online before print November 17, 2009, doi: 10.1073/pnas.0910803106
  2. ↑ K YTree. Дата обращения: 30 июля 2016. Архивировано 20 мая 2016 года.
  3. ↑ Karafet, Tatiana; Mendez, Fernando; Sudoyo, Herawati. Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia (англ.) // Nature : journal. — 2014. — Vol. 23. — P. 369—373. — doi:10.1038/ejhg.2014.106. — PMID 24896152. — PMC 4326703. Архивировано 11 июля 2017 года.
  4. ↑ Supplementary information 9. Philogenetic reconstruction of the Ust’Ishim Y-chromosome. Дата обращения: 6 декабря 2014. Архивировано 24 марта 2016 года.
  5. ↑ Palaeolithic DNA from Eurasia Архивная копия от 3 октября 2016 на Wayback Machine
  6. ↑ Posnik G. D. et al. (2016) Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences Архивная копия от 28 мая 2017 на Wayback Machine, Nature Genetics, 48, 593–599 (Poznik supp. fig. 15).
  7. ↑ Downloadable genotypes of present-day and ancient DNA data (compiled from published papers) | David Reich Lab. reich.hms.harvard.edu. Дата обращения: 11 сентября 2019. Архивировано из оригинала 2 ноября 2019 года.
  8. ↑ Manfred Kayser, Ying Choi, Mannis van Oven et al., "The impact of the Austronesian expansion: evidence from mtDNA and Y-chromosome diversity in the Admiralty Islands of Melanesia," Molecular Biology and Evolution (2008)
  9. ↑ Tatiana M. Karafet, Brian Hallmark, Murray P. Cox et al., "Major East-West Division Underlies Y Chromosome Stratification Across Indonesia," MBE Advance Access published March 5, 2010
  10. ↑ Y-DNA Haplogroup K and its Subclades - 2013 (англ.). International Society of Genetic Genealogy (4 января 2013). Дата обращения: 7 января 2013. Архивировано 11 января 2013 года.

Ссылки