Геногеографические исследования генофонда человечества, как правило, включают картографический анализ распространения генетических маркеров (в том числе — гаплогрупп) в популяциях крупных регионов и детальное изучение ряда конкретных популяций. Проводятся экспедиционные исследования и генотипирование различных ДНК и классических маркеров: мтДНК, Y-хромосом, генетико-биохимических и других генетических маркеров.
С 2005 года в планетарном масштабе реализуется международный проект «Генография»[1] — крупнейший геногеографический проект, исследующий изменчивость мтДНК и Y-хромосом населения территории Земли, имеющий целью составление детального генетического атласа народов мира и изучение древних миграций людей[2]. Бюджет проекта превышает 40 миллионов долларов США. Проект «Генография» финансируется Географическим обществом США, IBM и рядом спонсоров.