Muhlenberg a fost și președinte al consiliului de cenzori al statului Pennsylvania, și a fost numit receptor general al Pennsylvania Land Office la 8 ianuarie1800, funcție pe care a păstrat-o până la moartea sa în Lancaster, Pennsylvania, la 4 iunie 1801. A fost înmormântat în Cimitirul Woodward Hill de acolo. După moartea sa, orașul Muhlenberg a fost denumit în cinstea lui.
Există o legendă urbană care afirmă că Muhlenberg ar fi motivul pentru care germana nu a devenit cea de-a doua limbă oficială a Statelor Unite ale Americii. Motivul probabil pentru care această referire există este un vot din Camera Reprezentanților din 1794 prin care se respingea la limită, cu 42 la 41, petiția unui grup de imigranți germani care cerea ca toate legile să fie traduse în limba germană. Muhlenberg, care a fost unul din cei care a votat contra petiției, deși era evident de descendență germană, studiase în Germania și stăpânea limba precum orice vorbitor nativ și elevat al acesteia, ar fi declarat că „cu cât mai repede germanii devin americani, cu atât mai bine va fi” (conform originalului, "the faster the Germans become Americans, the better it will be").
Member of the [[United States Congressional Delegations from {{{state}}}|U.S. House of Representatives]] from [[{{{state}}}'s At-large congressional district|{{{state}}}'s At-large congressional district]] {{{years}}}
