Alianța pentru Unirea Românilor a încercat invalidarea mandatului de deputat, însă Francisc Tobă a depus jurămăntul de credință pe 17 februarie 2021, începându-și astfel cel de-al doilea mandat.[5]
Pe 2 august 1998 Parchetul de pe lângă Curtea Supremă l-a trimis în judecată pe Francisc Tobă pentru tentativă la omor deosebit de grav și complicitate la tratamente neomenoase, fapte din timpul Revoluței din decembrie 1989. Dosarul a fost ulterior restituit de către instanță parchetului.[8]
Pe 1 martie 2010 Patchetul General a închis dosarul lui Francisc Tobă pe motiv că faptele s-au prescris.[9]
