Dotado de uma grande capacidade de organização e de uma excelente forma de trabalho, Rui Faria foi por muito tempo o "braço direito" de Mourinho, seguindo-o desde os tempos em que trabalharam juntos no União de Leiria.[2] Foi treinador assistente na União de Leiria, no Porto, no Chelsea, na Internazionale, no Real Madrid e no Manchester United, se desligando em 2018 do treinador português.[3]
Num documentário[qual?] transmitido pela SIC[quando?] sobre José Mourinho, o Special One confessou que, quando abandonar ou for mais velho, Rui Faria será o seu grande sucessor.