O plano de 1929 de Max von Laue, vice-diretor desde 1922, de criar um instituto de fÃsica teórica não foi implementado. Depois que Einstein renunciou em 1933, a Fundação Rockefeller combinou em 1935 com o governo da Alemanha Nazista em estabelecer um instituto em Berlin-Dahlem. Em 1938 foi inaugurado o edifÃcio do Kaiser-Wilhelm-Institut für Physik, sendo equipado com equipamentos modernos para fÃsica nuclear e de baixa temperatura. Quando o projeto de energia nuclear alemão começou a ser estabelecido em 1940 , o diretor holandês Peter Debye deixou o instituto e emigrou para os Estados Unidos.
Em julho de 1942 Werner Heisenberg foi nomeado diretor. Heisenberg expandiu o programa de pesquisa para incluir raios cósmicos e fÃsica de partÃculas elementares. Durante a Segunda Guerra Mundial o instituto foi parcialmente evacuado para Hechingen em 1943. Pouco antes do fim da guerra em 1945, Heisenberg estava prestes a colocar um Reator nuclear em condição crÃtica pela primeira vez com o Forschungsreaktor Haigerloch.
Max-Planck-Gesellschaft (Hrsg.): Max-Planck-Institut für Physik. Reihe: Berichte und Mitteilungen der Max-Planck-Gesellschaft, Heft 1993/1, ISSN0341-7778.
Horst Kant: Max-Planck-Institut für Physik, Berlin – München, in: Denkorte. Max-Planck-Gesellschaft und Kaiser-Wilhelm-Gesellschaft. Brüche und Kontinuitäten, Sandstein-Verlag, Dresden 2011, ISBN 978-3-942422-01-7, S. 316–323.