O edifício foi construído entre 1645 e 1650 com fundos doados por Olimpia Aldobrandini Pamphili, que era descendente de calabreses como São Francisco. Foi projetada por Gioan Pietro Morandi e entregue aos frades mínimos, tornando-se em seguida a igreja nacional da comunidade calabresa em Roma. Um altar-mor em estilo barroco tardio foi criado por Giovanni Antonio de Rossi (c. 1655), a quem também se atribui o sacrário de madeira da igreja. Nenhum campanário foi construído especialmente para a igreja, que reutilizou a Torre dei Margani (ou Torre dei Borgia), do século XII, o que acabou por preservar o brasão medieval da torre.
Porém, a igreja como um todo só foi consagrada em 10 de julho de 1728 pelo papa Bento XIII. A parte inferior da fachada foi retrabalhada em gesso no século XVIII e toda a igreja passou por uma reforma em 1826, por ordem do papa Leão XII.
Capelas
A igreja abriga um ícone de São Francisco que, acredita-se, seja uma cópia de um retrato do santo. Outras cenas de sua vida e seus milagres podem ser vistas na sacristia. As obras de Giuseppe Chiari sobre o mesmo tema estão na segunda capela do lado sul.
