A fixação dessa fronteira aconteceu depois da Guerra do Paraguai, quando em 1872 foi firmado um tratado de paz com o Paraguai, no qual também constavam os respectivos limites com o Brasil, e que segundo Hélio Vianna, respeitava os convênios da época colonial e reivindicava, ao Brasil, somente as terras já ocupadas ou exploradas por portugueses e brasileiros.
Nos últimos anos, a fronteira entre o Brasil e o Paraguai passou a se transformar numa das principais rotas do tráfico internacional de drogas e de armas de fogo na América do Sul, além do contrabando e do descaminho de mercadorias e veículos roubados, com destaque em essencial para as mercadorias pirateadas. Isso vem acontecendo em grande parte devido à falta de fiscalização e de policiamento na região, principalmente por parte do governo paraguaio[carece de fontes?]. Em diversas cidades e áreas rurais ao longo da fronteira, esta pode ser atravessada tranquilamente, sem que seja necessário passar por nenhum tipo de fiscalização fronteiriça.
No lado paraguaio da fronteira, há um grande número de imigrantesbrasileiros, sendo que estes são popularmente conhecidos como brasiguaios. No Paraguai, os brasiguaios vêm se tornando alvo de um grande sentimento de xenofobia, já que a população paraguaia em geral, acusa os brasiguaios de estarem "abrasileirando" o Paraguai[carece de fontes?]. Por este motivo, muitos brasiguaios estão sofrendo retaliações no Paraguai, com as suas terras sendo invadidas e tomadas por camponeses revoltosos.