Quando a Ucrânia conquistou a independência da União Soviética em 1991, havia três distritos militares soviéticos em seu território.[2] Esses eram o Distrito Militar de Kiev, o Distrito Militar de Odessa e o Distrito Militar dos Cárpatos.[3] Em janeiro de 1998, o Comando Operacional Sul foi criado a partir do Distrito Militar de Odessa e da parte oriental do Distrito Militar de Kiev.[4] Em 2005, a Associação Operacional Sul foi criada a partir do Comando Operacional Sul.[5] Em outubro de 2013, o Comando Operacional Sul foi criado a partir da Associação Operacional Sul.[3] Em janeiro de 2015, o Comando Operacional Leste foi estabelecido com controle sobre as forças nos oblasts de Donetsk, Lugansk, Carcóvia, Dnipropetrovsk e Zaporíjia. Essas áreas eram controladas anteriormente pelo Comando Operacional Sul.[6] Na época, o comando era liderado pelo Tenente-general Serhiy Nayev.[7] As unidades sob o controle operacional do Comando Operacional Leste estiveram envolvidas na Guerra em Donbas.[8]
