Klub został założony 8 sierpnia 1920 roku[1] jako ŠK Spartak Myjava przez miejscowego kupca i mecenasa klubu Pana Samuela Vráblica. Do bardziej wszechstronnego rozwóju klubu doszło w latach 1937-1938, kiedy firma przeniosła się z Taus Petržalka do Myjavy. W 1944 roku zespół występował w dywizji Myjava, porównywalnej do byłej Słowackiej Ligi Narodowej. Przeważnie występował w lidze lokalnej, jedynie w latach 1968-1973 w mistrzostwach regionalnych. Po zakończeniu sezonu 1992/93 zespół awansował do nowo utworzonej 3. ligi (D4). W 2001 roku klub zmienił nazwę na MŠK Spartak Myjava, a w 2005 roku na TJ Spartak Myjava. Dopiero w sezonie 2009/10 debiutował w 2. lidze (D3). Po dwóch sezonach zespół zajął pierwsze miejsce w grupie zachodniej i awansował w 2011 do 1. ligi (D2). W następnym sezonie 2011/12 ponownie zdobył pierwsze miejsce i po raz pierwszy zdobył awans do najwyższej ligi.
Sukcesy
Trofea międzynarodowe
Nie uczestniczył w rozgrywkach europejskich (stan na 31-05-2012).
Trofea krajowe
Zdobyte trofea w rozgrywkach Słowacji (stan na: 31-05-2012)
Klub rozgrywa swoje mecze domowe na stadionie Spartak w Myjavie, który może pomieścić 2,000 widzów.
Europejskie puchary
Legenda do wszystkich tabel:
Q – runda eliminacyjna, 1/16, 1/8, 1/4, 1/2 – odpowiednia faza rozgrywek, Grupa – runda grupowa, 1r gr – pierwsza runda grupowa, 2r gr – druga runda grupowa, F – finał, R – runda, PO – play-off
k. – rzuty karne, los. – losowanie, Dogr. – dogrywka, w. – zasada bramek strzelonych na wyjeździe
