Urodził się w Lüdingworth (dzisiaj część Cuxhaven) w Dolnej Saksonii w rodzinie rolniczej. W roku 1761 stanął na czele ekspedycji badawczej wysłanej przez króla Danii i NorwegiiFryderyka V Oldenburga w celu przeprowadzania badań archeologicznych na Bliskim Wschodzie.
Owocem tej wyprawy było dzieło Reisebeschreibung von Arabien und anderen umliegenden Ländern (Opis podróży do Arabii i innych krajów ościennych) wydane w roku 1778. Zawierało ono opis aktualnej sytuacji w krajach Bliskiego Wschodu, zachowanych zabytków z przeszłości. W dziele tym Niebuhr zaproponował również podział pisma klinowego na trzy klasy, każda reprezentująca inny język (np. klasę I zaklasyfikował jako język staroperski). Po powrocie osiadł na stałe w Meldorf, gdzie pracował jako urzędnik i zmarł w roku 1815.
Bibliografia
Marian Bielicki: Zapomniany świat Sumerów. Warszawa: Państwowy Instytut Wydawniczy, 1966, s. 16-17.