Jorgos Karangunis został profesjonalnym piłkarzem w 1996 roku. W Panathinaikosie zadebiutował dwa lata później. Strzelał ważne gole dla klubu w Lidze Mistrzów i w Pucharze UEFA. Pamiętnym golem była bramka zdobyta bezpośrednio z rzutu wolnego przeciwko Manchesterowi United na Old Trafford. Sezon później jego gol strzelony głową przeciwko Arsenalowi pomógł Panathinaikosowi awansować do ćwierćfinału Ligi Mistrzów[3]. W Panathinaikosie grał do sezonu 2002/2003. Powrócił jednak do klubu i występował w nim ponowie w latach 2007–2012. Jako kapitan zespołu wygrał z nim mistrzostwo i Puchar Grecji. Występował również w Interze Mediolan, Benfice i Fulham[4].
Podczas Euro 2012 w meczu inauguracyjnym przeciwko Reprezentacji Polski przy stanie 1:1 Karangunis nie wykorzystał rzutu karnego dla Grecji (Przemysław Tytoń obronił). Mecz zakończył się wynikiem 1:1. 16 czerwca w trzecim meczu grupowym przeciwko Rosji w Warszawie zapewnił swojej drużynie zwycięstwo 1:0. Grecy awansowali do ćwierćfinału[5].