Miasto powstało najprawdopodobniej około 800 roku. Najstarszą wzmianką o jego znaczeniu jako siedziby handlu morskiego jest adnotacja z roku 1224 z Londynu o „statku handlowym z Emden”. Od 1464 było stolicą Hrabstwa Fryzji Wschodniej. Rewolucja znana dziś jako „Emder Revolution” z roku 1595 doprowadziła do wygnania hrabiego Wschodniej Fryzji z miasta. Wybrany w 1604 roku syndyk miasta Johannes Althusius poprowadził je ku bogactwu. W 1744 Wschodnią Fryzję wraz z miastem anektowało Królestwo Prus.
W Emden znajduje się zakład produkcyjny Volkswagena, w którym produkuje się VW Passata. Ponadto w mieście rozwinął się przemysł stoczniowy, maszynowy, rybny oraz rafineryjny[2].
Związki z Polską
W roku 1543 Jan Łaski otrzymał od regentkiFryzji wschodniej Anny oldenburskiej nominację na stanowisko efora wszystkich kościołów tego państwa i proboszcza parafii w Emden. Łaski stał się duchownym ewangelickim i pionierem Reformacji we Fryzji, umiejętnie prowadząc działalność misyjną między naciskami ze strony katolików i anabaptystów. Łaski napisał swój manifest teologiczny Epitome oraz opracował katechizm. Odniósł sukces, eliminując katolicyzm z terenu księstwa. Wyjechał w 1550 r. do Anglii.