Klub założony został 14 kwietnia1945 roku pod nazwą Aurora de la Guardia de Honor, skróconą w następnym roku do nazwy Aurora. W Liga Mayor klub zadebiutował w 1947 roku, a w 17 lat później zdobył pierwsze mistrzostwo Gwatemali. Mistrzostwo w 1984 roku Aurora zdobyła pod wodzą trenera Rubéna Amorína, a w 1986 roku po wodzą Jorge Roldána, który doprowadził także zespół Aurory do tytułu w sezonie 1992/93. W roku 2005Aurora niespodziewanie spadła do drugiej ligi. Klub, który jest własnością armii gwatemalskiej, gra obecnie w drugiej lidze gwatemalskiej (Primera División de Guatemala).