Santiago de Querétaro er en by og hovedstad i den meksikanske delstaten Querétaro. Byen ble grunnlagt i 1531. Santiago de Querétaro er blant annet berømt for sin akvedukt som var byens hovedforsyning av vann fra 1726 til 1970.
Det historiske sentrum i byen er på listen over UNESCOs liste over verdens kultur- og naturarvsteder.