Han har spilte for Viktoria Plzeň, Chmel Blšany, Sparta Praha, Rennes og Chelsea. Petr Čech var rangert som verdens beste målvakt i 2006. Før overgangsvinduet i januar 2008 signaliserte Čech at han, i likhet med lagkameraten Didier Drogba, hadde vært meget interessert om et tilbud fra FC Barcelona skulle dukke opp. I sesongen 2006-2007 pådro Čech seg en alvorlig hodeskade, som satte karrièren hans i fare. Han ble operert og ble frisk, men ble pålagt bruk av hjelm når han spilte kamp. Skaden satte ingen stopper for hans videre karrière, og han har nå vunnet alt med Chelsea.
Čech vil spesielt huskes fra Champions League-finalen i mai 2012 mot Bayern München der han spilte en sentral rolle. Čech reddet blant annet et straffespark fra tidligere Chelsea-spiller Arjen Robben i ekstraomgangen.
Etter at han la opp, ble han ansatt som rådgiver for teknikk og prestasjon i Chelsea.[5]