I 1760 ble landsbyen Tsjertanla (russisk: Чертанла) grunnlagt av gammeltroende. Landsbyen vokste og fikk innvilget bystatus og fikk nytt navn, Novyj Uzen (russisk: Новый Узень), i 1835. Navnet ble senere endret til Novouzensk.
Novouzensk er et senter for et kornproduserende område.